[发明专利]一种鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷的DNA条形码及其鉴别方法和应用在审
申请号: | 202010881827.3 | 申请日: | 2020-08-28 |
公开(公告)号: | CN111876496A | 公开(公告)日: | 2020-11-03 |
发明(设计)人: | 杨超杰;刘艳;杜垳轶;周立谦;陈振波 | 申请(专利权)人: | 海南热带海洋学院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6806;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 董大媛 |
地址: | 572022*** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 未定 sp 横带髭鲷 dna 条形码 及其 鉴别方法 应用 | ||
1.一种鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷的DNA条形码,其特征在于,所述髭鲷未定种sp的DNA条形码序列如SEQ ID No.1所示;所述横带髭鲷的DNA条形码序列如SEQ ID No.2所示。
2.扩增权利要求1所述的DNA条形码的引物,其特征在于,包括F296和R515;所述F296的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;所述R515的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。
3.一种利用权利要求1所述的DNA条形码鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷的方法,包括以下步骤:
1)提取待鉴别样本的基因组DNA获得待鉴别DNA;
2)以步骤1)中获得的待鉴别DNA为模板,以权利要求2所述的引物进行PCR扩增获得扩增产物;
3)将所述扩增产物的序列与DNA条形码进行比对;如果所述扩增产物的序列和髭鲷未定种sp的DNA条形码一致,则待鉴别样本为髭鲷未定种sp;如果所述扩增产物的序列和横带髭鲷的DNA条形码一致,则待鉴别样本为横带髭鲷。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,步骤2)中所述PCR扩增的扩增体系以25.15μL计,包括以下组分:超纯水17.5μL,10×buffer 2.5μL,dNTPs 2μL,rTaq 0.15μL,待鉴别DNA 1μL,引物F296 1μL,引物R515 1μL。
5.根据权利要求3或4所述的方法,其特征在于,步骤2)中所述PCR扩增的扩增程序如下:
94℃预变性3min;94℃变性20s,50℃退火20s,72℃延伸20s,38个循环;72℃延伸5min,4℃保存。
6.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述扩增产物的序列通过测序获得。
7.权利要求1所述的鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷的DNA条形码、权利要求2所述的扩增所述DNA条形码的引物在鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷中的应用。
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