[发明专利]一种预测鼻咽癌预后的肿瘤微环境成分标志物组合及系统有效

专利信息
申请号: 202010633755.0 申请日: 2020-07-02
公开(公告)号: CN111910000B 公开(公告)日: 2022-07-01
发明(设计)人: 马骏;陈雨沛;柳娜;孙颖;李文斐;吕佳蔚;王雅琴;李晓敏;李君炎;张磐磐;黎映琴;唐玲珑;毛燕萍;周冠群;何庆梅;杨晓静 申请(专利权)人: 中山大学肿瘤防治中心(中山大学附属肿瘤医院;中山大学肿瘤研究所)
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11;G16B30/00;G16H50/20
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 许飞
地址: 510060 广东省广州*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 预测 鼻咽癌 预后 肿瘤 环境 成分 标志 组合 系统
【说明书】:

发明公开了一种预测鼻咽癌预后的肿瘤微环境成分标志物组合及系统,包括细胞周期增殖成分和巨噬细胞、浆细胞样树突状细胞、CLEC9A+树突状细胞、自然杀伤细胞和浆细胞五种免疫细胞成分中的至少一种。本发明一些实例,通过计算一种肿瘤细胞成分和五种免疫细胞成分各自的特征基因的表达量,可以预测鼻咽癌肿瘤微环境中不同成分的表达高低,并可对鼻咽癌患者进行临床预后预测,有助于实行个体化治疗,最终给患者带来生存获益。

技术领域

本发明涉及生物领域,特别涉及一种预测鼻咽癌预后的肿瘤微环境成分标志物组合及系统。

背景技术

鼻咽癌是我国最为常见的头颈部肿瘤,尤为好发于华南地区,也被称之为“广东瘤”。根据不同的临床分期,鼻咽癌的目前治疗方式亦不相同,主要是以放疗与化疗为核心,辅以靶向治疗、免疫治疗等多学科综合治疗。随着治疗方式的革新以及规范化治疗的推行,早期鼻咽癌患者的生存率以及生活质量都获得了提高,然而中晚期患者的预后仍旧不佳,同一临床分期的患者经过同样的治疗后会出现不同的预后结果,反映了肿瘤之间的生物异质性,因此加深对鼻咽癌生物学特性的了解成为目前研究的焦点之一。鼻咽癌的肿瘤组织除了含有高异质性的肿瘤细胞外,还包括病灶部位的浸润免疫细胞等,这些细胞成分共同构成了肿瘤微环境,而肿瘤微环境中不同细胞成分的差异可影响肿瘤的生物学特性,并进而可能会导致不同的预后结果。因此,通过深入解析鼻咽癌肿瘤微环境的构成成分,有助于了解鼻咽癌的生物学特性,并可用于预测鼻咽癌患者的临床预后,实行个体化治疗,最终给患者带来生存获益。

鼻咽癌相关的因子众多,差异表达的mRNA众多,已有大量的文献报导了多种NPC预后相关的标志物,然而如何从众多标志物筛选得到可以用于确定NPC预后的标志物组合,依然是一项具有挑战性的工作。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的至少一种不足,提供一种预测鼻咽癌预后的肿瘤微环境成分标志物组合及系统。

本发明所采取的技术方案是:

本发明的第一个方面,提供:

一组预测鼻咽癌预后的肿瘤微环境成分标志物,包括细胞周期增殖成分和五种免疫细胞成分中的至少一种,其中:

所述细胞周期增殖成分的特征基因为DEPDC1、DLGAP5、HJURP、PBK、TOP2A、GTSE1、ASPM、CDC20、CEP55、CKAP2L、HMMR、NEK2、BIRC5、CCNA2、MKI67、FAM64A、KIF4A、KIF2C、CENPF、AURKB、KIF14、NUF2、ESCO2、NUSAP1、NCAPG、CDCA3、CDCA5、CENPE、KIF20A和CENPA;

所述五种免疫细胞成分分别为巨噬细胞成分、浆细胞样树突状细胞成分、CLEC9A+树突状细胞成分、自然杀伤细胞成分和浆细胞成分,

所述巨噬细胞成分的特征基因为APOE、APOC1、RNASE1、CTSL、C1QA、C1QB、C1QC、CTSD、ADAMDEC1、SPP1、FTL、NUPR1、GPNMB、FCGR3A、CCL8、PLD3、LGMN、GLUL、CTSC、CD163、PSAP、CTSB、CCL3、HES1、MMP9、MS4A4A、IFIT1、ACP5、PLA2G7、CD68、MAFB、CD14、IFI6、TREM2、MS4A7、PRDX1、ASAH1、LGALS3、CCL4、IFI27、MARCKS、CREG1、CD81、SLC40A1、CTSS、FCER1G、CXCL9;

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