[发明专利]采用微流控装置的空间编码生物分析

权利要求书

1.确定样品中靶标多核苷酸的位置的方法，包括：

(a)将附着在支撑物上的样品加载至具有多条第一寻址通道的第一微流控装置，其中第一寻址通道识别所述样品中的第一区域；

(b)通过所述第一寻址通道将第一探针传递至所述样品中的所述第一区域，其中所述第一探针包括(i)与所述靶标多核苷酸的至少一部分基本互补的序列，(ii)识别所述样品中的所述第一区域的第一地址标签，以及(iii)第一连接区域；

(c)将附着在所述支撑物上的所述样品加载至具有多条第二寻址通道的第二微流控装置，其中第二寻址通道识别所述样品中的第二区域，所述第二区域与所述第一区域相交；和

(d)通过所述第二寻址通道将第二探针传递至所述样品中的所述第二区域，其中所述第二探针包括：(i)识别所述样品中的所述第二区域的第二地址标签，和(ii)第二连接区域，其中所述第二探针与所述第一探针通过所述第一连接区域和所述第二连接区域之间的连接在所述第一区域和所述第二区域的相交点结合，所述第一地址标签和所述第二地址标签用于确定所述样品中位于所述相交点的靶标多核苷酸的位置。

2.确定样品中靶标蛋白的位置的方法，包括：

(a)将第一探针传递至所述样品，其中所述第一探针包括：(i)特异性结合所述靶标蛋白的结合部分，和(ii)与所述结合部分结合的寡核苷酸；

(b)将所述样品加载至具有多条第一寻址通道的第一微流控装置，其中第一寻址通道识别所述样品中的第一区域；

(c)通过所述第一寻址通道将第二探针传递至所述样品中的所述第一区域，其中所述第二探针包括：(i)与步骤(a)所述的寡核苷酸的部分序列基本互补的序列，(ii)与靶标多核苷酸的一部分基本互补的序列，(iii)识别所述样品中的所述第一区域的第一地址标签，和(iv)第一连接区域；

(d)将来自步骤(c)的样品加载至具有多条第二寻址通道的第二微流控装置，其中第二寻址通道识别所述样品中的第二区域，所述第二区域与所述第一区域相交；和

(e)通过所述第二寻址通道将第三探针传递至所述样品中的所述第二区域，其中所述第三探针包括(i)识别所述样品中的所述第二区域的第二地址标签，和(ii)第二连接区域，其中所述第二探针与所述第三探针通过所述第一连接区域和所述第二连接区域之间的连接在所述第一区域和所述第二区域的相交点结合，所述第一地址标签和所述第二地址标签用于确定所述样品中位于所述相交点的靶标蛋白的位置。

3.确定样品中靶标蛋白的位置的方法，包括：

(a)将用于靶标蛋白的第一探针传递至样品中的多个位置，所述第一探针包括：(i)能够特异性结合靶标蛋白的结合部分，和(ii)与所述结合部分结合的寡核苷酸；

(b)将第二探针传递至所述样品中的第一位置，其中所述第二探针包括：(i)与步骤(a)所述的寡核苷酸的部分序列基本互补的序列，(ii)与靶标多核苷酸的至少一部分基本互补的序列，(iii)识别所述样品中的所述第一位置的第一地址标签，和(iv)第一连接区域；和

(c)将第三探针传递至所述样品中的第二位置，其中所述第三探针包括(i)识别所述样品中所述第三探针被传递到的所述第二位置的第二地址标签，和(ii)第二连接区域，其中所述第二探针与所述第三探针通过所述第一连接区域和所述第二连接区域之间的连接在所述样品中所述第一位置和所述第二位置的相交点结合，所述第一地址标签和所述第二地址标签用于确定位于所述相交点的所述靶标蛋白的位置。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述多条第一寻址通道基本上相互平行且所述多条第二寻址通道基本上相互平行。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述多条第一寻址通道和/或所述多条第二寻址通道是n条寻址通道，其中n是20到1000之间的整数。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述多条第一寻址通道的每条通道和/或所述多条第二寻址通道的每条通道的宽度是大约1μm至大约500μm。