[发明专利]一种创制高粒重、低垩白、中等直链淀粉含量和低糊化温度水稻种质的方法

权利要求书

1.一组基因组合作为靶点在创制高粒重、低垩白、中等直链淀粉淀粉含量和低糊化温度的种质材料中的应用；所述的基因组合包括以下三组:(1)粒重、粒型和垩白率的主效基因：选自gs3、GW5、GL7以及Lgy3基因中的两种及两种以上；其中gs3在第3染色体的16,733,441位存在特异性变异，C：短粒/T：长粒；GW5在第5染色体的第5,365,520位碱基存在特异性变异，T：短粒/C：长粒，GL7在第7染色体的第24,666,092位碱基存在特异性变异，A：短粒/C：长粒，Lgy3在第3染色体的第6,053,302位碱基存在特异性变异，G：短粒/T：长粒；(2)直链淀粉含量主效基因：选自中等直链淀粉含量的Wx等位基因型Wx^b或Wxⁱⁿ，其中Wx^b的第6染色体的第1,765,415位碱基为“T”，Wxⁱⁿ第6染色体的第1,768,006位碱基为“T”；(3)糊化温度主效基因：ALK基因在第6染色体的第6,748,824位碱基存在特异性变异，C：低糊化温度/G：高糊化温度，在第6染色体的第67,523,57位碱基存在特异性变异，A：低糊化温度/G：高糊化温度。

2.在创制高粒重、低垩白、中等直链淀粉淀粉含量和低糊化温度的种质材料中应用的KASP标记引物组合物，其特征在于所述的KASP标记引物组合物为鉴别权利要求1中所述的基因组合中各基因碱基特异性变异对应的KASP标记引物的组合物；鉴别gs3基因在第3染色体的16,733,441位碱基特异性变异的引物序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3所示，鉴别GW5基因在第5染色体的第5,365,520位碱基特异性变异的引物序列如SEQ IDNO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6所示，鉴别GL7在第7染色体的第24,666,092位碱基特异性变异的引物序列如SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9所示，鉴别Lgy3基因在第3染色体的第6,053,302位碱基特异性变异的引物序列如SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11、SEQ IDNO.12所示，鉴别Wx^b基因在第6染色体的第1,765,415位碱基特异性变异的引物序列如SEQID NO.13、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15所示，鉴别Wxⁱⁿ在第6染色体的第1,768,006位碱基特异性变异的引物序列如SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23、SEQ ID NO.24所示，鉴别ALK基因在第6染色体的第6,748,824位碱基特异性变异的引物序列如SEQ ID NO.25、SEQ IDNO.26、SEQ ID NO.27所示，鉴别ALK基因在第6染色体的第67,523,57位碱基特异性变异的引物序列如SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.30所示；其中引物SEQ ID NO.1、SEQID NO.4、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.23、SEQ ID NO.26、SEQID NO.29标记FAM；引物SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.11、SEQ IDNO.14、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.28标记HEX。

3.一种创制高粒重、低垩白、中等直链淀粉淀粉含量和低糊化温度的水稻种质的方法，其特征在于包含：

(1)以“扬籼9B”为轮回亲本，以“象牙香占”为母本杂交获得F₁；

(2)种植F₁单株，以扬籼9B为轮回亲本，回交获得BC₁F₁种子，田间种植40株BC₁F₁植株，并利用权利要求2所述的KASP标记引物组合物检测每个单株的基因型，从中选择同时携带gs3、GL7、ALK^L基因型的5个单株与轮回亲本扬籼9B进行回交，获得BC₂F₁种子；

(3)田间种植100株BC₂F₁植株，并利用权利要求2所述的KASP标记引物组合物检测每个BC₂F₁单株的基因型，从中选择同时携带gs3、GL7和ALK^L基因型的单株与轮回亲本扬籼9B进行回交获得BC₃F₁种子；

(4)田间种植200株BC₃F₁植株，利用权利要求2所述的KASP标记引物组合物检测每个单株基因型，从中获得同时携带gs3、GL7和ALK^L基因型的121个单株，收获每个单株的种子用于测定千粒重、粒长和粒宽。