[发明专利]一种研究蛋白质及药物-蛋白质复合体构象多态性的方法

权利要求书

1.一种测定待测分子与蛋白或多肽结合构象的方法，其特征在于，包括步骤：

1）制备蛋白或多肽溶液；

2）加入待测分子，充分混合；

3）将混合液加到导电性基底表面；

4）使用扫描探针显微镜进行扫描获得STM图像；

5）统计分析待测分子在肽链上的结合结构、位点和数量，获得能量分布差；

其中，能量分布差的计算公式为：

，

其中，Ei、Ej分别为构象i、j的能量，Pi、Pj分别为构象i、j的分布概率，k_B为玻尔兹曼常数，T为绝对温度。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，1）中蛋白或多肽溶液与伴侣分子共混，制备混合液。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述伴侣分子与肽链C-末端羧基形成氢键。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述伴侣分子为4Bpy。

5.根据权利要求1-4任一项所述的方法，其特征在于，1）中的溶液或权利要求2中所述的混合液进行超声处理。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述导电性基底包括石墨基底、金属基底、氧化物基底、半导体基底。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述石墨为高定向热解石墨。

8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，3）还包括除去基底表面残留液。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，采用吹惰性气体的方式除去基底表面残留液。

10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于，惰性气体为氮气。

11.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述待测分子为药物、染料、抗体或药物前体。

12.一种测定待测分子与蛋白或多肽结合构象的设备，其特征在于，包括：

1）液体混合装置；所述液体混合装置用于制备蛋白或多肽溶液；

2）上样装置；所述上样装置用于加入待测分子，充分混合；

3）组装体形成装置；所述组装体形成装置用于将混合液加到导电性基底表面

4）显微扫描装置；所述显微扫描装置用于使用扫描探针显微镜进行扫描获得STM图像；

5）计算输出装置；所述计算输出装置输出待测分子在肽链上的结合结构、位点和数量，获得能量分布差，所述能量分布差通过公式：

进行计算，其中，Ei、Ej分别为构象i、j的能量，Pi、Pj分别为构象i、j的分布概率，k_B为玻尔兹曼常数，T为绝对温度。

13.权利要求1-11任一项所述的方法或权利要求12所述的设备在靶向蛋白药物开发中的应用。