[发明专利]一种基于PCR-MS质谱扫描鉴别伊蚊种类的方法有效

专利信息
申请号: 202010056713.5 申请日: 2020-01-19
公开(公告)号: CN111334583B 公开(公告)日: 2023-03-31
发明(设计)人: 曹晓梅;张晓龙;杨宇;李颖;刘莹莹;王怀远 申请(专利权)人: 中国检验检疫科学研究院
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/686;C12Q1/6872
代理公司: 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 代理人: 王敏
地址: 100000 北京市大*** 国省代码: 北京;11
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 基于 pcr ms 扫描 鉴别 种类 方法
【权利要求书】:

1.一种基于PCR-MS质谱扫描鉴别伊蚊种类的方法,其特征在于,包括下述步骤:

1)建立伊蚊基因数据库:通过BOLDSYSTEMSDNA条形码数据库和NCBI DNA数据库,获得伊蚊基因序列;

2)建立伊蚊DNA二维码:通过Sequencher5.3软件聚类分析伊蚊基因序列,选取种类特异性的单核苷酸多态性SNP为靶标,建立伊蚊DNA二维码分形图;

3)多重PCR-MS引物设计:基于伊蚊DNA二维码分形图,使用MassARRAY AssayDesigner4.0软件,设计多重PCR特异性引物和探针;所述多重PCR特异性引物和探针如SEQID NO.1~SEQ ID NO.54所示;

4)多重PCR-MS质谱扫描:提取待测伊蚊的基因组,并依次进行前PCR反应、SAP酶处理、单碱基延伸和质谱分析,得出待检测伊蚊的具体种类。

2.根据权利要求1所述的一种基于PCR-MS质谱扫描鉴别伊蚊种类的方法,其特征在于,步骤4)中,以Complete PCR Reagent试剂盒进行前PCR扩增,PCR扩增的体系为:

试剂 体积

H2O HPLC grade 1.3µL

10×PCR Buffer含20mMMgCl2 0.5µL

25mM MgCl2 0.4µL

25mM dNTP mix 0.1µL

1µM Primer mix 0.5µL

5U/µLhot star Taq polymerase 0.2µL

总体积 3.0µL;

反应程序为:

3.根据权利要求2所述的一种基于PCR-MS质谱扫描鉴别伊蚊种类的方法,其特征在于,步骤4)中,以Complete PCR Reagent试剂盒进行SAP酶消化,SAP酶处理的过程包括:

步骤一取出PCR反应产物,4000rpm离心l min;

步骤二取出SAP反应试剂,试剂融化后,涡漩振荡20秒后掌式离心机离心l min;

步骤三配制SAP反应MIX:

试剂 体积

H2O 1.53µL

10×SAP Buffer 0.17µL

1.7U/µLSAP enzyme 0.30µL

总体积 2µL;

步骤四在384孔微量滴定板的每孔中加入2µL的SAP混合物,封口,混匀,并在4000rpm下离心1 min;

步骤五将离心后的滴定板在37℃ 40min;85℃ 5min下孵育,然后4℃保存。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国检验检疫科学研究院,未经中国检验检疫科学研究院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202010056713.5/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top