[发明专利]使用单一测定分析多种分析物在审
申请号: | 201980065037.3 | 申请日: | 2019-11-25 |
公开(公告)号: | CN112867801A | 公开(公告)日: | 2021-05-28 |
发明(设计)人: | 弗兰克·J·斯蒂默斯;张帆;德米特里·K·波克洛克;史蒂文·诺伯格 | 申请(专利权)人: | ILLUMINA公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6834 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 使用 单一 测定 分析 多种 | ||
1.一种核酸文库,所述核酸文库包括:
互补DNA(cDNA)文库,其来源于mRNA分子并且包含具有第一标签的核酸,所述第一标签包含第一条形码;以及
基因组DNA(gDNA)文库,其来源于基因组DNA并且包含具有第二标签的核酸,所述第二标签包含第二条形码,
其中所述第一条形码和所述第二条形码是相同或不同的,并且其中所述第一条形码和所述第二条形码识别所述cDNA文库和所述gDNA文库的共同来源,并且
其中所述cDNA文库和所述gDNA文库被共隔室化并在相同环境中制备。
2.根据权利要求1所述的核酸文库,所述核酸文库还包含片段标签化试剂。
3.根据权利要求2所述的核酸文库,其中所述片段标签化试剂将所述第一标签附接于mRNA,并且将所述第二标签附接于所述gDNA。
4.根据权利要求1所述的核酸文库,其中所述第一标签通过逆转录而附接于所述mRNA,并且其中所述第二标签通过片段标签化而附接于所述gDNA。
5.根据权利要求1所述的核酸文库,其中所述核酸文库附接于固体载体。
6.根据权利要求5所述的核酸文库,其中所述固体载体是基板、经蚀刻的表面、孔、覆盖孔、密封孔、阵列、流通池装置、微流体通道、小珠、磁性小珠、柱、小滴或微粒。
7.根据权利要求1所述的核酸文库,其中所述第一标签和所述第二标签还包含底物识别序列。
8.根据权利要求7所述的核酸文库,其中所述第一标签的所述底物识别序列与所述第二标签的所述底物识别序列是相同的。
9.根据权利要求1所述的核酸文库,其中所述第一条形码和所述第二条形码是相同的。
10.根据权利要求1所述的核酸文库,其中所述第一标签和所述第二标签是相同的。
11.根据权利要求1所述的核酸文库,其中所述核酸文库由细胞群、单个细胞、细胞核群或单个细胞核产生。
12.根据权利要求1所述的核酸文库,其中所述第一标签是polyA标签。
13.根据权利要求1所述的核酸文库,其中所述第二标签包含转座酶特异性元件。
14.根据权利要求1所述的核酸文库,其中所述第一条形码和所述第二条形码通过片段标签化反应直接掺入到所述核酸文库中。
15.一种流通池装置,所述流通池装置包括:
用于捕获RNA的第一探针,其中所述第一探针包含第一条形码和第一底物识别序列;
用于捕获DNA的第二探针,其中所述第二探针包含第二条形码和第二底物识别序列;
其中所述第一条形码和所述第二条形码是相同或不同的,并且其中所述第一条形码和所述第二条形码识别所述RNA和DNA的共同来源,并且
其中所述第一探针和所述第二探针被配置为在单个隔室中同时分析来自样本的RNA和DNA。
16.根据权利要求15所述的流通池装置,其中所述第一探针和所述第二探针固定在所述流通池装置上。
17.根据权利要求15所述的流通池装置,其中所述第一条形码和所述第二条形码是相同的。
18.根据权利要求15所述的流通池装置,其中所述第一底物识别序列与所述第二底物识别序列是相同的。
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