[发明专利]一种编码LTBP2基因突变体的核酸及其应用在审
| 申请号: | 201911164645.8 | 申请日: | 2019-11-25 |
| 公开(公告)号: | CN110938684A | 公开(公告)日: | 2020-03-31 |
| 发明(设计)人: | 王开宇 | 申请(专利权)人: | 福州福瑞医学检验实验室有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11;G01N33/68 |
| 代理公司: | 北京中济纬天专利代理有限公司 11429 | 代理人: | 张磊 |
| 地址: | 350012 福建省福州市晋*** | 国省代码: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 编码 ltbp2 基因 突变体 核酸 及其 应用 | ||
本发明涉及一种编码LTBP2基因突变体的核酸及其应用,属于基因工程技术领域。该突变体与野生型相比,具有c.4936G>C突变,其编码的多肽的氨基酸序列具有p.Glu1646Gln突变。通过检测该新突变体是否存在,可有效筛选出易患原发性先天性青光眼的生物样品;本发明的检测方法快速、准确、高效;本发明可用于原发性先天性青光眼患者的分子诊断和鉴别诊断,为原发性先天性青光眼患者的早期诊断、早期治疗提供科学依据。本发明可用于筛查原发性先天性青光眼携带者,可以为携带者提供遗传咨询建议和指导,降低后代患原发性先天性青光眼的几率。
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种编码LTBP2基因突变体的核酸及其应用。具体地,本发明涉及分离的编码LTBP2突变体的核酸、分离的LTBP2突变体多肽、筛选易患原发性先天性青光眼的生物样品的方法。
背景技术
原发性先天性青光眼是严重的少见的婴幼儿致盲眼病,是儿童青光眼中最常见的类型。原发性先天性青光眼发病率存在明显的种族和地域差异,其中欧洲国家总发病率为1:10000,印第安人群为1:3300,中东沙特阿拉伯约为1:2500。我国原发性先天性青光眼的发病率尚无准确的统计数字,根据已有报道先天性青光眼占儿童青光眼住院患者的40%左右。原发性先天性青光眼严重危害患者的视力和视觉发育,如不能早期诊断、及早治疗和干预,致盲率可达到100%。
原发性先天性青光眼通常由CYP1B1、LTBP2、TEK基因突变引起,其中LTBP2基因位于14q24.3,临近GLC3C基因座1.3Mb附近,编码LTBP2蛋白,含有36个外显子和35个内含子,编码含有1821个氨基酸的基质蛋白。它是4种LTBP家族蛋白之一,LTBP家族蛋白含有表皮生长因子样结构域和8个半胱氨酸结构域的多结构域糖蛋白,与原纤维蛋白微原纤维相互作用的细胞外基质的主要成分。LTBP2蛋白在全身多个弹性组织中大量表达,在眼部小梁网中以相对较高的水平表达,在Descemet膜和晶状体上皮层中表达最高。在睫状突的非色素上皮、小梁网和巩膜与角膜基质之间也观察到其表达。LTBP2在眼部的结构和功能发挥中起到重要作用。LTBP2基因的常染色体隐性致病突变可导致原发性先天性青光眼。而携带一个LTBP2基因杂合致病突变的个体虽然往往无明显临床症状,但可把致病变异遗传给后代。由于原发性先天性青光眼非常罕见,因此中国人原发性先天性青光眼的报道十分有限,具有诊断价值的致病位点较少。
因而,目前原发性先天性青光眼的致病基因的确定以及原发性先天性青光眼的检测方法仍有待深入研究。
发明内容
本发明的目的在于提供一种LTBP2基因突变体,并提出一种能够有效筛选易患原发性先天性青光眼的生物样品的方法。
本发明的目的通过如下技术方案实现:
根据原发性先天性青光眼医学研究领域的最新进展,利用第二代测序法分析原发性先天性青光眼相关基因已在原发性先天性青光眼患者分子诊断,发现新致病基因和致病变异研究中得到初步应用。第二代测序利用设计的DNA序列探针将目标基因区域捕获下来,然后针对每个外显子进行深度测序。利用该技术流程寻找原发性先天性青光眼致病基因的研究已成研究热点。例如Saeedi等(Saeedi,Osamah,Yousaf,Sairah,Tsai,Joby,等.Delineation of Novel Compound Heterozygous Variants in LTBP2 Associated withJuvenile Open Angle Glaucoma[J].Genes,9.11)利用第二代测序技术对1个青少年开角型原发性先天性青光眼家系进行全外显子组检测,发现该家系携带LTBP2基因的2个新致病突变。由此可见,第二代测序技术正在推动原发性先天性青光眼诊断及其机制研究的迅速发展。
因而,发明人针对一个原发性先天性青光眼患者,采用26基因的原发性先天性青光眼基因包,通过目标区域捕获的高通量第二代测序技术,最终确定了原发性先天性青光眼的一个新的致病突变位点——LTBP2基因的c.4936G>C突变。
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