[发明专利]一种KFS致病基因新突变及其应用

说明书

本发明公开了与KFS相关的VANGL1基因的SNP突变位点，并提供一种检测VANGL1易感SNP位点基因型的试剂。进一步，本发明公开了一种KFS辅助诊断的试剂盒。本发明筛选了KFS相关的易感基因的SNP位点并提供其在KFS诊断中的应用，阐述SNP对于KFS进展的影响，揭示其在诊断、治疗中价值。因此，本发明可开发出利用SNP基因型对KFS的诊断进行检测的试剂盒和生物制剂，不仅能够快速有效的做到早期诊断，其精确度大大提高，而且为基因治疗、药物治疗等临床应用提供了治疗靶点和重要依据。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，具体涉及一种KFS致病基因新突变及其应用。

背景技术

先天性颈椎融合畸形(Klippel-Feil Syndrome，KFS)是一种先天性的颈椎椎体发育畸形，发病率约为1/40000-1/42000，其临床典型特点为：颈部短粗、后发际低、颈部活动受限；但只有不到50％的患者同时具有三项表现。

KFS多合并多种先天性疾病和其他系统畸形，患者的神经压迫症状从神经根病到四肢麻痹、死亡等均可出现，还可造成严重的身心问题，给家庭和社会造成极大负担。

目前，因缺乏早期预测手段，KFS患者多在出现颈椎严重畸形时才被发现，治疗方法仅能通过支具或手术矫形来控制颈椎畸形的进展，但对其他系统畸形病变无法改善。因此，探索早期预测、诊断方法和病因治疗靶点是当前KFS的研究热点。但目前KFS病因未明，近年的研究表明KFS的病因可能与基因突变、环境因素以及发育异常相关，其中尤以基因突变最为密切。基因突变在KFS的发生、发展过程中起着非常重要的作用。

发明内容

本发明的目的是针对解决上述技术问题，提出一种与KFS疾病相关的基因易感SNP位点及其在制备检测或治疗KFS疾病产品中的应用。

本发明的第二目的是提供一种检测VANGL1易感SNP位点基因型的试剂。

本发明的第三个目的是提供一种KFS辅助诊断的试剂盒。

发明人收集KFS患者血液样本通过全外显子水平寻找基因的致病性突变，并通过小量样本进行基因型验证，进一步证实新突变是有害的，可以作为KFS诊断标志物，为预测疾病发展和指导临床早期干预提供理论依据，早日实现KFS的个体化早期诊断和治疗。

为实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

首先，本发明提供了一种VANGL1易感SNP位点，所述SNP位点为：

人类第1号染色体第116227985位碱基由C到G的SNP位点突变，所述位点突变具体信息为NM_001172412.1:c.1151CG(p.Pro384Arg)。

进一步地，本发明提供一种检测VANGL1易感SNP位点基因型的试剂，所述试剂包括用于扩增所述SNP位点的引物对，或是包括用于扩增所述SNP位点的引物对和限制性内切酶，所述SNP位点为：

人类第1号染色体第116227985位碱基由C到G的SNP位点突变，所述位点突变具体信息为NM_001172412.1:c.1151CG(p.Pro384Arg)。

优选的，扩增所述SNP位点的引物对具有SEQIDNO:3-4所示的核苷酸序列。

优选的，所述引物对扩增的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示。

更进一步地，本发明提供一种KFS辅助诊断的试剂盒，其包括检测VANGL1:NM_001172412.1:c.1151CG的SNP位点基因型的试剂。

优选的，包括用于扩增所述SNP位点的引物对，或是包括用于扩增所述SNP位点的引物对和限制性内切酶。

优选的，所述引物对具有SEQIDNO:3-4所示的核苷酸序列。