[发明专利]基于云的生物信息数据交付方法、装置和电子设备在审
申请号: | 201910739964.0 | 申请日: | 2019-08-12 |
公开(公告)号: | CN110659252A | 公开(公告)日: | 2020-01-07 |
发明(设计)人: | 杨超;蔡潇潇;刘涛;谢德啸;李志民;李大为;玄兆伶;王海良;王娟 | 申请(专利权)人: | 安诺优达生命科学研究院;浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达(义乌)医学检验有限公司;北京安诺优达医学检验实验室有限公司;安诺优达基因科技(北京)有限公司 |
主分类号: | G06F16/16 | 分类号: | G06F16/16;H04L29/08;G16B30/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 322000 浙江省金华市义乌*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生物信息数据 交付 云平台 上传 电子设备 用户访问 下载 存储 便利 响应 | ||
公开了一种基于云的生物信息数据交付方法、装置和电子设备。该基于云的生物信息数据交付方法包括:获取生物信息数据;将所述生物信息数据进行拆分以获得待上传的生物信息数据;以及,将所述待上传的生物信息数据上传到云平台,所述云平台上存储的所述生物信息数据用于通过响应于用户的请求由用户访问和/或下载而交付给用户。这样,提高了数据交付的便利度和安全性,并降低了数据交付的成本。
技术领域
本申请涉及生物信息数据领域,且更为具体地,涉及一种基于云的生物信息数据交付方法、装置和电子设备。
背景技术
高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generationsequencing technology),能够一次性并行地对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,以使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能。
基于高通量测序技术的高通量测序仪所获得的下机数据通常都是以TB(T比特)级别的数据,并且这些下机数据还可能经过进一步的分析处理以获得其它生物信息数据,而获得这些生物信息数据的一个主要目的就是将其交付给客户。
因此,期望提供能够将大数据量的生物信息数据交付给用户的方案。
发明内容
为了解决上述技术问题,提出了本申请。本申请的实施例提供了一种基于云的生物信息数据交付方法、基于云的生物信息数据交付装置和电子设备,其将生物信息数据进行拆分后上传到云平台,以基于云平台将这些数据交付给用户,从而提高了数据交付的便利度和安全性,并降低了数据交付的成本。
根据本申请的一个方面,提供了一种基于云的生物信息数据交付方法,包括:获取生物信息数据;将所述生物信息数据进行拆分以获得待上传的生物信息数据;以及,将所述待上传的生物信息数据上传到云平台,所述云平台上存储的所述生物信息数据用于通过响应于用户的请求由用户访问和/或下载而交付给用户。
在上述基于云的生物信息数据交付方法中,将所述生物信息数据进行拆分以获得待上传的生物信息数据包括:基于标签和引物序列将多样本混合的生物信息数据拆分为单样本的生物信息数据。
在上述基于云的生物信息数据交付方法中,将所述生物信息数据进行拆分以获得待上传的生物信息数据包括:确定拆分后的数据文件的数目;确定拆分后的数据文件的大小;基于所述拆分后的数据文件的数目和大小编辑指定汇总文件;以及,基于所述指定汇总文件获得所述待上传的生物信息数据。
在上述基于云的生物信息数据交付方法中,基于所述拆分后的数据文件的数目和大小编辑指定汇总文件包括:基于所述拆分后的数据文件的大小对样本数据进行质控分析;响应于所述单样本的生物信息数据的质控分析不合格,重新获取所述样本的生物信息数据;以及,响应于所述单样本的生物信息数据的质控分析合格,将所述生物信息数据汇总到指定文件夹。
在上述基于云的生物信息数据交付方法中,基于所述拆分后的数据文件的大小对样本数据进行质控分析包括:确定所述拆分后的数据文件的大小是否大于或者等于预期数据文件大小的15%;以及,响应于所述拆分后的数据文件的大小大于或者等于预期数据文件大小的15%,确定所述单样本的生物信息数据的质控分析合格。
在上述基于云的生物信息数据交付方法中,基于所述拆分后的数据文件的大小对样本数据进行质控分析包括:确定所述拆分后的数据文件中的N碱基的比例是否小于或等于3%;以及,响应于所述拆分后的数据文件中的N碱基的比例小于或等于3%,确定所述单样本的生物信息数据的质控分析合格。
在上述基于云的生物信息数据交付方法中,将所述待上传的生物信息数据上传到云平台包括:将所述待上传的生物信息数据上传到所述云平台的第一存储空间,所述第一存储空间内存储的生物信息数据配置为允许用户访问和/或下载到第二存储空间而不允许用户更改和/或删除;和,所述第二存储空间内存储的生物信息数据配置为允许用户更改和/或删除。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于安诺优达生命科学研究院;浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达(义乌)医学检验有限公司;北京安诺优达医学检验实验室有限公司;安诺优达基因科技(北京)有限公司,未经安诺优达生命科学研究院;浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达(义乌)医学检验有限公司;北京安诺优达医学检验实验室有限公司;安诺优达基因科技(北京)有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
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