[发明专利]基于云的生物信息数据交付方法、装置和电子设备在审
申请号: | 201910739964.0 | 申请日: | 2019-08-12 |
公开(公告)号: | CN110659252A | 公开(公告)日: | 2020-01-07 |
发明(设计)人: | 杨超;蔡潇潇;刘涛;谢德啸;李志民;李大为;玄兆伶;王海良;王娟 | 申请(专利权)人: | 安诺优达生命科学研究院;浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达(义乌)医学检验有限公司;北京安诺优达医学检验实验室有限公司;安诺优达基因科技(北京)有限公司 |
主分类号: | G06F16/16 | 分类号: | G06F16/16;H04L29/08;G16B30/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 322000 浙江省金华市义乌*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生物信息数据 交付 云平台 上传 电子设备 用户访问 下载 存储 便利 响应 | ||
1.一种基于云的生物信息数据交付方法,包括:
获取生物信息数据;
将所述生物信息数据进行拆分以获得待上传的生物信息数据;以及
将所述待上传的生物信息数据上传到云平台,所述云平台上存储的所述生物信息数据用于通过响应于用户的请求由用户访问和/或下载而交付给用户。
2.根据权利要求1所述的基于云的生物信息数据交付方法,其中,将所述生物信息数据进行拆分以获得待上传的生物信息数据包括:
基于标签和/或引物序列将多样本混合的生物信息数据拆分为单样本的生物信息数据。
3.根据权利要求1所述的基于云的生物信息数据交付方法,其中,将所述生物信息数据进行拆分以获得待上传的生物信息数据包括:
确定拆分后的数据文件的数目;
确定拆分后的数据文件的大小;
基于所述拆分后的数据文件的数目和大小编辑指定汇总文件;以及
基于所述指定汇总文件获得所述待上传的生物信息数据。
4.根据权利要求3所述的基于云的生物信息数据交付方法,其中,基于所述拆分后的数据文件的数目和大小编辑指定汇总文件包括:
基于所述拆分后的数据文件的大小对样本数据进行质控分析;
响应于所述单样本的生物信息数据的质控分析不合格,重新获取所述样本的生物信息数据;以及
响应于所述单样本的生物信息数据的质控分析合格,将所述生物信息数据汇总到指定文件夹。
5.根据权利要求4所述的基于云的生物信息数据交付方法,其中,基于所述拆分后的数据文件的大小对样本数据进行质控分析包括:
确定所述拆分后的数据文件的大小是否大于或者等于预期数据文件大小的15%;
响应于所述拆分后的数据文件的大小大于或者等于预期数据文件大小的15%,确定所述单样本的生物信息数据的质控分析合格。
6.根据权利要求4所述的基于云的生物信息数据交付方法,其中,基于所述拆分后的数据文件的大小对样本数据进行质控分析包括:
确定所述拆分后的数据文件中的N碱基的比例是否小于或等于3%;
响应于所述拆分后的数据文件中的N碱基的比例小于或等于3%,确定所述单样本的生物信息数据的质控分析合格。
7.根据权利要求4所述的基于云的生物信息数据交付方法,其中,将所述待上传的生物信息数据上传到云平台包括:
将所述待上传的生物信息数据上传到所述云平台的第一存储空间,所述第一存储空间内存储的生物信息数据配置为允许用户访问和/或下载到第二存储空间而不允许用户更改和/或删除;和
所述第二存储空间内存储的生物信息数据配置为允许用户更改和/或删除。
8.根据权利要求7所述的基于云的生物信息数据交付方法,其中,所述第二存储空间内存储的生物信息数据配置为允许用户使用所述云平台提供的分析处理工具进行分析处理。
9.根据权利要求3所述的基于云的生物信息数据交付方法,其中,所述指定汇总文件包括基于二代测序数据的fq格式数据文件或者基于三代测序数据的bam数据文件。
10.根据权利要求1所述的基于云的生物信息数据交付方法,其中,所述待上传的生物信息数据包括对获得的下机数据进行生物信息统计分析获得的生物信息数据,
所述生物信息数据包括以下的至少其中之一:过滤统计结果文件、比对统计结果文件、表达量文件及表达量统计结果文件、差异分析统计结果文件、功能富集分析结果文件、蛋白质相互作用文件、可变剪切文件、新转录本预测文件、异检测文件、转录因子预测文件及其对应的配置文件。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于安诺优达生命科学研究院;浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达(义乌)医学检验有限公司;北京安诺优达医学检验实验室有限公司;安诺优达基因科技(北京)有限公司,未经安诺优达生命科学研究院;浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达(义乌)医学检验有限公司;北京安诺优达医学检验实验室有限公司;安诺优达基因科技(北京)有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
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