[发明专利]一种自动标注医学文本中实体的方法在审

专利信息
申请号: 201910630653.0 申请日: 2019-07-12
公开(公告)号: CN110348015A 公开(公告)日: 2019-10-18
发明(设计)人: 管仁初;刘洪涛;张浩;贺宝润;周丰丰 申请(专利权)人: 北京百奥知信息科技有限公司
主分类号: G06F17/27 分类号: G06F17/27;G16H50/70
代理公司: 成都瑞创华盛知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 51270 代理人: 邓瑞;辜强
地址: 100089 北京市海淀*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 标注 文本 词典数据 自动标注 预处理 嵌套 文本预处理 后处理 词组词典 模糊识别 文本数据 缩写词 医学 去除 应用
【说明书】:

发明公开了一种自动标注医学文本中实体的方法,该方法的目的是正确标注文本中的实体,包括以下步骤:收集文本;文本预处理;收集实体词典数据;对词典数据进行预处理,生成缩写词词典、词组词典和其他实体词典;应用标注规则对文本数据进行标注,获得标注实体;标注后处理,采用模糊识别方式对标注结果进行处理,增加漏识别的实体以及去除嵌套实体,最后得到最终的标注结果。

技术领域

本发明属于医学实体标注技术领域,特别是涉及一种自动标注医学文本中实体的方法。

背景技术

在医学命名实体识别领域,使用的技术一般是通过训练模型,然后通过模型去标注实体,其中训练模型使用的数据大部分是通过人工标注得到,这需要耗费大量的人力、物力,并且标注结果中的实体类型较少,整体标注的数量少,同时也会产生一些误差,因此需要一种自动标注的方法来解决该问题,使标注的过程更加智能化、简单化,使标注结果更加准确化。

发明内容

有鉴于此,本发明要解决的技术问题是对医学语料中的实体进行标注方法,该方法能够自动标注实体,对文本中出现的医学实体能够精确标注,从而替代研究人员的手工标注过程,加快研究步伐。

本发明替代医学实体标注过程中的人工标注,包括对复数实体、嵌套实体、不规范实体的处理方法,其方法将由文本收集、文本预处理、词典数据收集、词典构建、文本标注、标注后处理组成。

文本收集:将要标注的医学文本数据进行收集。

文本预处理:将文本进行分句、分词处理,并且对分词结果进行词形还原操作。

词典数据收集:将需要的词典数据进行收集。

词典构建:将得到的词典数据进行处理,构建缩写词词典、词组词典、其他实体词典(该词典中不包含缩写词与词组)。

文本标注:利用标注方法对医学文本数据进行标注。

标注后处理:对标注好的数据进行处理,解决一些漏标注的实体以及嵌套实体。

标注方法:

方法一:如果单词为缩写,则直接进行标注。

方法二:如果不是缩写词,则先与词典中的实体进行匹配,如果匹配成功直接标注为实体,否则将单词的首字母变为小写,再与词典中的实体进行匹配,如果匹配成功则标注为实体,否则标注为其他类型。

方法三:如果出现嵌套的实体,则只标注最长的实体,对嵌套在内部的实体不进行标注。

附图说明

图1是本发明的结构图。

具体实施方式

下面结合具体实施例和附图对本发明作进一步的说明。

如图1所示,一种自动标注医学文本中实体的方法,该方法包含了对医学实体的自动标注过程的处理方法,以及处理复数实体、嵌套实体等而采用的组合方法。所述的自动标注方法标注的语料是医学语料,其标注结果更加偏向于医学实体,例如疾病、药物、不良反应、基因等。所述组合方法可以有效解决复数实体、嵌套实体以及因标点符号不规范导致实体无法识别的问题,提高了标注的准确率。

其方法将由文本收集、文本预处理、词典数据收集、词典构建、文本标注、标注后处理组成。

文本收集:将要标注的医学文本数据进行收集。

文本预处理:将文本进行分句、分词处理,并且对分词结果进行词形还原操作。

词典数据收集:将需要的词典数据进行收集。

词典构建:将得到的词典数据进行处理,构建缩写词词典、词组词典、其他实体词典(该词典中不包含缩写词与词组)。

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