[发明专利]DNA编码化合物库构建中通过Suzuki偶联反应得到On-DNA芳烃化合物的方法有效
申请号: | 201910609569.0 | 申请日: | 2019-07-08 |
公开(公告)号: | CN110359097B | 公开(公告)日: | 2022-09-20 |
发明(设计)人: | 吴阿亮;曲毅;陈琳琳;高红;赵蒙;温石阳;徐艳芬;陈雯婷;李科;蒯乐天;杨洪芳;彭宣嘉 | 申请(专利权)人: | 上海药明康德新药开发有限公司 |
主分类号: | C40B50/10 | 分类号: | C40B50/10;C40B40/06 |
代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 | 代理人: | 郑权 |
地址: | 200131 上海市浦东*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna 编码 化合物 构建 通过 suzuki 反应 得到 on 芳烃 方法 | ||
1.一种DNA编码化合物库构建中的由On-DNA芳基卤代物制备On-DNA芳烃化合物的方法,其特征在于,所述On-DNA芳基卤代物的结构式为:DNA-Ar-X,在1~100摩尔当量的钯催化剂和1~100摩尔当量的配体存在下,摩尔浓度为0.1~5.0mM的DNA-Ar-X溶液、10~1000摩尔当量的乙烯基三氟硼酸钾或N-氨基甲基三氟硼酸钾和10~2000摩尔当量的碱在20~100℃下反应0.5~24小时直至反应结束;
其中,结构式中的DNA是由经人工修饰的和/或未修饰的核苷酸单体聚合得到的单链或双链的核苷酸链;X是氯、溴、或碘;
其中,结构式中的Ar是单环或双环的芳香环,所述On-DNA芳基卤代物的卤素连接于Ar的环上;
其中,结构式中的DNA与Ar通过一个或多个化学键连接。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述Ar选自以下基团:
R1为氢、卤素、氨基、硝基、氰基、羟基、巯基、芳基甲酮、烷基甲酮、C1-C12烷基、C1-C6烯烃基、C1-C6炔烃基、C3-C8环烷基、C1-C6烷基氧基、C1-C6烷基氨基中的任意一种至多种的随机组合,Ar上有一个或多个R1基团;R2为连接DNA部分的功能团,具体是一个与DNA上的功能团互补反应的功能团,或是氨基、羧基、醛基、芳卤中的任意一种,R2直接与Ar相连,或间隔多个化学键与Ar相连;Y为O、S、NH或烷基取代氨基中的任意一种。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述DNA-Ar-X的摩尔浓度是0.1mM、0.2mM、0.3mM、0.4mM、0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1.0mM、1.5mM、2.0mM、2.5mM、3.0mM、3.5mM、4.0mM、4.5mM或5.0mM。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述反应的反应溶液是含乙腈、二甲基甲酰胺、二甲基乙酰胺、N-甲基吡咯烷酮、二甲基亚砜、甲醇、乙醇、叔丁醇、异丙醇、四氢呋喃、1,4-二氧六环、无机盐缓冲液、有机酸缓冲液、有机碱缓冲液中的任意一种或几种的含水的混合溶剂,且最终反应液中水的含量不低于20%。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述钯催化剂是氯化钯、溴化钯、碘化钯、双(乙腈)二氯化钯、乙二胺氯化钯、三氟乙酸钯、乙酸钯、硫酸钯、硝酸钯、二丙酸钯、乙酰丙酮钯、六氟乙酰丙酮钯、二氯(降冰片二烯)钯、(1,5-环辛二烯)二氯化钯、二氯(N,N,N,N-四甲基乙二胺)钯、二氯(1,10-菲咯啉)钯、双(二亚苄基丙酮)钯、三(二亚苄基丙酮)二钯、四(乙腈)二(三氟甲磺酸)钯、四(三苯基膦)钯、四(三邻甲苯基膦)钯、三苯基膦醋酸钯、双(三-o-甲苯磷)钯、双[1,2-双(二苯基膦)乙烷]钯、双(三叔丁基膦)钯、二氢二氯双(二叔丁基羟亚膦基)钯、双(三苯基膦)二氯化钯、(1,3-双(二苯基膦)丙烷)氯化钯、[1,1'-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯、[1,1'-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯二氯甲烷络合物、二溴双(三叔丁基膦)二钯、1,1'-双(二-叔丁基膦)二茂铁二氯化钯、双(三环己基膦)二氯化钯中的一种或几种的混合物。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述钯催化剂的摩尔当量是1当量、2当量、3当量、4当量、5当量、6当量、7当量、8当量、9当量、10当量、20当量、30当量、40当量、50当量、60当量、70当量、80当量、90当量或100当量。
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