[发明专利]一种与猪乳头内陷相关的SNP标记及其应用

说明书

本发明公开一种与猪乳头内陷相关的SNP标记及其应用，所述SNP分子标记包括以下至少一个位点：(1)位于猪13号染色体上的MIR138基因，GenBank序列号：NC_010455.5所示序列的27449811bp处，该SNP位点为rs81256086，碱基变化为T/C；(2)位于猪13号染色体上的ANO10基因，GenBank序列号：NC_010455.5所示序列的26877847bp处，该SNP位点为rs327526761，碱基变化为A/G。上述SNP标记可以应用于检测猪乳头是否内陷和辅助猪育种。

技术领域

本发明属于分子生物检测技术领域，具体涉及一种与猪乳头内陷相关的SNP 标记及其应用。

背景技术

有效乳头数是衡量母猪哺育能力的重要指标，因为母乳是哺乳仔猪早期唯一的营养来源，发育不成熟的瞎乳头、内陷乳头、夹在正常乳头之间的副乳头等，都会导致母猪的内分泌机能失调，最终会影响乳汁的分泌，导致产后无法分泌乳汁或分泌量要远少于正常乳头。另外充足的有效乳头数量还可为仔猪寄养提供依据，更利于保证初生仔猪成活所以在选择后备母猪时有效乳头数极为重要。先天性乳头缺陷主要包括乳导管闭合、乳头细小、乳头内陷等，其中乳头内陷是最重要也是最常见一种，内陷乳头的特征在于乳头不能从乳房表面突出，乳头管向内固定，形成一个小坑，阻止正常的乳汁流动，仔猪不能吮吸到奶水。尽管群体内乳头数与产仔数的相关性并不明确，但繁殖力高的品种比如梅山猪总是有较多的乳头数，所以养猪业传统上对于母猪选择压力主要于有效乳头数。猪的有效乳头数与产仔数和泌乳力具有生理上的正相关，即乳头数多的种猪，其产仔数和泌乳力亦高。能留作种用的公猪和后备母猪应具备以下条件，至少有14个位置合适、发育良好的乳头，这些乳头的排列应该保持平行且易于被仔猪接触到。母猪乳头功能的缺失常常导致母猪不能同时哺育11头或者12头仔猪，导致仔猪死亡率上升。患有内陷乳头的公猪不能作为种猪使用。因此，找到内陷乳头的遗传方式并解析其分子病理机制是猪育种进程中亟待解决的重要问题之一。特别是，当乳头数量小于产仔数时，有效的功能性乳头起着重要作用，过少的有效乳头数会导致仔猪奶水不足而生长消瘦甚至死亡，影响猪场经济效益。然而，与猪的其他繁殖性状相比，乳头性状的研究较为有限。这种疾病对猪的生产有相当大的负面影响。如何提高母猪有效乳数量是养猪业健康高效、可持续发展的关键，也是当前遗传育种研究的重点和热点。研究猪乳头内陷性状相关的SNP标记对于揭示影响猪乳头内陷遗传机制和高哺乳能力的猪的选育具有重要意义。

MIR138基因全长84bp，调控靶向mRNA表达，通过靶向许多与细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移相关的靶基因而对肿瘤起到抑制作用。目前已经被试验验证过的MIR138靶基因有58个，其中与乳腺发育相关的基因有13个，其中Akt1基因的缺陷会导致乳腺发育缺陷，包括导管生长和终末芽形成的缺陷；细胞水平，Bcl11a 基因表达的减少会导致乳腺上皮干细胞和祖细胞数量的减少；EZH2基因的敲减会导致青春期乳腺上皮延迟生长；Sox9基因在小鼠乳腺中的条件性敲除导致出生后乳腺发育受损。此外，还有报道称MiR-138调控的靶序列之一为催乳素受体，会影响小鼠乳腺发育、泌乳过程。试验证明沉默MiR-138的表达会促进催乳素受体蛋白的表达量而促进乳腺的发育，促进小鼠乳腺上皮细胞的增殖以及乳腺导管的扩增，泌乳量的增加。反之，MIR138的过表达会抑制小鼠乳腺上皮细胞的存活和增殖。以上结果均说明MIR138在乳腺发育过程中有重要作用，因此将其作为研究猪内陷乳头发病的候选基因。