[发明专利]一种鼠伤寒沙门菌MLVA分型的检测引物组、试剂盒及其应用有效
申请号: | 201910105795.5 | 申请日: | 2019-02-01 |
公开(公告)号: | CN109609668B | 公开(公告)日: | 2022-06-14 |
发明(设计)人: | 杨小鹃;吴清平;张菊梅;曾海燕;余树波;王涓;薛亮;吴浩明;张淑红 | 申请(专利权)人: | 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/10;C12N15/11;C12R1/42 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 胡素丽;刘明星 |
地址: | 510070 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 伤寒 沙门 mlva 检测 引物 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种鼠伤寒沙门菌MLVA分型的检测引物组,其特征在于,由下列引物组成:
针对MLVA1位点:
MLVA1-F:5’-CCGGTACTGTCAGGGAAAGA-3’,MLVA1-R:5’-AGCATACCAAACGACCGCTA-3’;
针对MLVA2位点:
MLVA2-F:5’-GCTGGATGTTCTGGCGGAC-3’,MLVA2-R:5’-GAATATCGGCAGCATGGG-3’;
针对MLVA3位点:
MLVA3-F:5’-CGTTTATTCGGGCATGCG-3’,MLVA3-R:5’-TCTGGTGGGGAGAATGACTG-3’;
针对MLVA4位点:
MLVA4-F:5’-AAGAATGCCCCGGAATATGC-3’,MLVA4-R:5’-AGCATGACAGTCCCGGTTC-3’。
2.一种鼠伤寒沙门菌MLVA分型试剂盒,其特征在于,包括多重PCR扩增试剂和检测引物组,所述的检测引物组由下列引物组成:
针对MLVA1位点:
MLVA1-F:5’-CCGGTACTGTCAGGGAAAGA-3’,MLVA1-R:5’-AGCATACCAAACGACCGCTA-3’;
针对MLVA2位点:
MLVA2-F:5’-GCTGGATGTTCTGGCGGAC-3’,MLVA2-R:5’-GAATATCGGCAGCATGGG-3’;
针对MLVA3位点:
MLVA3-F:5’-CGTTTATTCGGGCATGCG-3’,MLVA3-R:5’-TCTGGTGGGGAGAATGACTG-3’;
针对MLVA4位点:
MLVA4-F:5’-AAGAATGCCCCGGAATATGC-3’,MLVA4-R:5’-AGCATGACAGTCCCGGTTC-3’。
3.一种非疾病的诊断和治疗目的的鼠伤寒沙门菌MLVA分型方法,其特征在于,包括以下步骤:提取待测鼠伤寒沙门菌的基因组DNA作为模板,以权利要求1所述的MLVA1-F/MLVA1-R、MLVA2-F/MLVA2-R、MLVA3-F/MLVA3-R和MLVA4-F/MLVA4-R作为扩增引物进行多重PCR扩增,对多重PCR扩增产物进行测序,根据测序结果对待测鼠伤寒沙门菌进行MLVA分型。
4.根据权利要求3所述的鼠伤寒沙门菌MLVA分型方法,其特征在于,所述的多重PCR扩增的反应体系为25μL,包括10×PCR buffer 2.5μL,3.0mmol/L MgCl2,250μmol/L dNTP,引物MLVA1-F/MLVA1-R、MLVA2-F/MLVA2-R、MLVA3-F/MLVA3-R和MLVA4-F/MLVA4-R各120nmol/L,1.5U Taq酶,模板2μL,余量为ddH2O。
5.根据权利要求3所述的鼠伤寒沙门菌MLVA分型方法,其特征在于,所述的多重PCR扩增的反应条件为95℃预变性5min;95℃变性45s、58℃退火45s、72℃延伸45s,共进行30个循环;72℃延伸10min。
6.根据权利要求3所述的鼠伤寒沙门菌MLVA分型方法,其特征在于,所述的根据测序结果对待测鼠伤寒沙门菌进行MLVA分型具体为根据测序结果采用本地Blast分析法对待测鼠伤寒沙门菌MLVA1、MLVA2、MLVA3、MLVA4位点重复数结果判定,根据4个位点的重复数对待测鼠伤寒沙门菌进行MLVA分型。
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