[发明专利]一种用于检测脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌克拉霉素药物敏感性的引物探针组合

说明书

本发明公开了一种用于检测脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌克拉霉素药物敏感性的引物探针组合。本发明提供一种检测脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌克拉霉素药物敏感性快速检测方法，从分子水平快速完成对脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌克拉霉素耐药性的快速检测，具有简便、快速、高特异性和高灵敏性的特点，从而解决了现有分子技术无法准确、快速鉴定脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌对克拉霉素敏感性的问题。

技术领域

本发明涉及一种用于检测脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌克拉霉素药物敏感性的引物探针组合。

背景技术

非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM)是指除及麻风分枝杆菌以外的所有分枝杆菌菌种。根据其生长速度不同，NTM可以分为快生型分枝杆菌和慢生型分枝杆菌，其中快生型分枝杆菌中最常见的致病菌为脓肿分枝杆菌，约占所有快生型分枝杆菌病分离株的70％以上，并且呈逐年增多的趋势。

脓肿分枝杆菌复合群对一线抗结核药物天然耐药，对普通抗菌药物也大多无效，治疗方案通常是以克拉霉素等大环内酯类抗生素为核心的多药联合方案，治愈率仅有约60％，因此是NTM病是治疗的重点和难点。致病性脓肿分枝杆菌复合群主要包括脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌，尽管在生物学方面表现出很强的相似性，但是两种菌种对克拉霉素不同的耐药特性，因此，早期完成对脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌克拉霉素的耐药性分析对于提高感染脓肿分枝杆菌复合群患者的治愈率有重要意义。

发明内容

本发明的目的是提供一种用于检测脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌对克拉霉素药物敏感性的引物探针组合。

本发明首先保护引物探针组合A，由引物F2、引物R2和探针P2组成；

所述引物F2为如下(b1)或(b2)：

(b1)序列表的序列4所示的单链DNA分子；

(b2)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子；

所述引物R2为如下(b3)或(b4)：

(b3)序列表的序列5所示的单链DNA分子；

(b4)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子；

所述探针P2为如下(b5)或(b6)：

(b5)序列表的序列6所示的单链DNA分子；

(b6)将序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列6具有相同功能的DNA分子。

本发明还保护引物探针组合B，由引物探针组合A和引物探针组I组成；

引物探针组I由引物F1、引物R1和探针P1组成；

所述引物F1为如下(a1)或(a2)：

(a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子；

(a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子；

所述引物R1为如下(a3)或(a4)：

(a3)序列表的序列2所示的单链DNA分子；

(a4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子；

所述探针P1为如下(a5)或(a6)：

(a5)序列表的序列3所示的单链DNA分子；

(a6)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子。