[发明专利]诊断方法

权利要求书

1.一种用于测定癌细胞或肿瘤细胞是否将对化学物质产生抗性的方法，其中所述方法包括以下步骤：

a)将包括或由从诊断患有癌症的个体获得的癌细胞或肿瘤细胞组成的一个或多个样品暴露于化学物质，其中所述诊断患有癌症的个体先前未给予过所述化学物质；

b)测定a)中所使用的所述一个或多个样品中与产生癌症药物抗性相关的基因的表达量；

c)测定来自所述诊断患有癌症的个体的所述一个或多个样品中与b)中相同的所述基因的表达量，所述样品未暴露于a)中所用的所述化学物质；

其中b)中测定的表达量与c)中测定的所述表达量相比升高指示所述样品中所包括的癌细胞或肿瘤细胞对所述化学物质产生抗性。

2.一种用于测定先前诊断患有癌症的个体是否将对用于治疗所述癌症的化学物质产生抗性的方法，其中所述方法包括以下步骤：

a)将包括或由从所述诊断患有癌症的个体获得的肿瘤细胞癌组成的一个或多个样品暴露于化学物质，其中所述诊断患有癌症的个体先前未给予过所述化学物质；

b)测定a)中所使用的所述一个或多个样品中与产生癌症药物抗性相关的基因的表达量；

c)测定来自所述诊断患有癌症的个体的所述一个或多个样品中与b)中相同的所述基因的表达量，所述样品未暴露于a)中所用的所述化学物质；

其中所述诊断患有癌症的个体在获得所述一个或多个样品之前未给予过a)中所用的所述化学物质，并且其中b)中测定的表达量与c)中测定的所述表达量相比升高指示患者对所述化学物质产生抗性。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述一个或多个样品通过活检获得。

4.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述样品由血液中的循环肿瘤细胞获得。

5.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中与产生抗性相关的所述基因是选自由以下组成的群组的基因：SOX2、Nanog、OCT4、FGF4、FBX15、FOXP4、KLF9、CD24、CD271、CD36、ITLN2、TNFSF12、NOX3、CLEC7A、ACYAP1、UNC5C、UNC5D、MUC16、VAV3、FOXD3、VGLL3、ALPP、C3、F2R、ENPP2、ETV4、NTNG1、NTRK2、ROBO1和ROBO2。

6.根据权利要求5所述的方法，其中与产生抗性相关的所述基因为SOX2。

7.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中癌症为非黑素瘤皮肤癌、食管胃腺癌、成胶质细胞瘤、膀胱癌、膀胱尿道上皮癌、食管胃癌、黑素瘤、非小细胞肺癌、子宫内膜癌、宫颈腺癌、食管鳞状细胞癌、乳癌、头颈鳞状细胞癌、生殖细胞肿瘤、小细胞肺癌、卵巢癌、软组织肉瘤、肝细胞癌、结肠直肠腺癌、宫颈鳞状细胞癌、胆管癌、前列腺癌、上尿路尿道上皮癌、弥漫性神经胶质瘤、结肠直肠癌、壶腹癌、肾上腺皮质癌、头颈癌、肾透明细胞癌、肝胆癌、神经胶质瘤、非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma)、间皮瘤、唾液腺癌、肾非透明细胞癌、杂类神经上皮肿瘤、嗜铬细胞瘤、胸腺肿瘤、多发性骨髓瘤、肾细胞癌、骨癌、胰腺癌、白血病、周围神经系统肿瘤、甲状腺癌、B成淋巴细胞白血病、单克隆B细胞淋巴细胞增多、淋巴瘤、毛状细胞白血病、急性骨髓白血病、威尔姆斯肿瘤(Wilms tumor)，尤其黑素瘤和非小细胞肺癌。

8.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述化学物质为受体酪氨酸激酶(RTK)的抑制剂、EGFR路径的抑制剂(EGFRi)或MAPK路径的抑制剂(MAPKi)，其中优选地，所述MAPKi为B-Raf的抑制剂(BRAFi)、MEK的抑制剂(MEKi)或ERK的抑制剂(ERKi)。