[发明专利]用于表征与微生物相关联的阑尾相关病症的方法和系统

说明书

用于表征一种或多种阑尾相关病症的方法和/或系统的实施例，可以包括基于微生物数据集，确定与一组受试者相关联的微生物数据集；和/或执行与一种或多种阑尾相关病症相关联的表征处理，其中执行所述表征处理可以附加地或可替代地包括执行一种或多种阑尾相关病症的阑尾相关表征处理，和/或确定一种或多种治疗。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2017年7月18日提交的，序列号为62/533,816的美国临时申请的权益，该临时申请的全部内容通过引用合并于此。

本申请与于2017年5月26日提交的，序列号为15/606,743的美国申请相关，该申请是于2015年10月21日提交的，序列号为14/919,614的美国申请的继续申请，该继续申请要求于2014年10月21日提交的，序列号为62/066,369的美国临时申请、于2014年12月4日提交的，序列号为62/087,551的美国临时申请、于2014年12月17日提交的，序列号为62/092,999的美国临时申请、2015年4月14日提交的，序列号为62/147,376的美国临时申请、于2015年4月14日提交的，序列号为62/147,212的美国临时申请、于2015年4月14日提交的，序列号为62/147,362的美国临时申请、于2015年4月13日提交的，序列号为62/146,855的美国临时申请、于2015年8月18日提交的，序列号为62/206,654的美国临时申请的权益，该临时申请的全部内容通过引用合并于此。

技术领域

本发明一般地涉及基因组学和微生物学。

背景技术

微生物组可以包括与生物体相关的共栖的(commensal)、共生的(symbiotic)和致病的微生物生态群落。人类微生物组的表征是一个复杂的过程。人类微生物组包括的微生物细胞比人类细胞多10倍以上，然而，由于样本处理技术、遗传分析技术以及用于处理大量数据的资源的限制，人类微生物组的表征仍处于新兴阶段。当前的知识已经清楚地确定了微生物组与多种健康状况的关系，已逐渐成为宿主遗传和环境因素在人类疾病发展中的媒介。微生物组被怀疑在许多健康/疾病相关状态中起着至少部分的作用。此外，微生物组可以介导环境因素对人类、植物和/或动物健康的影响。考虑到微生物组在影响使用者健康方面的深远意义，应该继续努力，确定微生物组表征，从表征中产生见解(insight)，并且开发用于矫正微生态失调状态的疗法。然而，用于分析人类微生物组和/或基于所获得的见解提供治疗措施的方法和系统，尚有许多问题未得到解答。

因此，在微生物学领域中，需要一种新的和有用的方法和/或系统，用于表征、监测、诊断和/或干预一种或多种微生物相关的健康状况，例如实现个性化(individualized)和/或人群广泛(population-wide)的使用。

附图说明

图1A-1B为方法的一个实施例的变体的流程图；

图2描述了方法和系统的一个实施例；

图3描述了在方法的一个实施例中，用于生成表征模型的过程的变体；

图4描述了基于益生菌的疗法在一种方法的实施例中操作机制的变体；

图5描述了在方法的一个实施例中样本处理的变体；

图6描述了通知规定的示例；

图7描述了该方法的一个实施例的变体的示意图；

图8A-8B描述了利用模型执行表征处理的变体；

图9描述了在方法的一个实施例中促进治疗。

具体实施方式

以下对实施例的描述并非旨在限制实施例，而是使本领域技术人员能够制造和使用。

1.概述