[发明专利]T-DM1癌症治疗效果的预测

权利要求书

1.一种治疗癌症患者的方法，包括：

a.检测并定量从患者获得的肿瘤细胞中的HER2蛋白的水平，其中，所述肿瘤样品含有一个或多个HER2基因的突变；

b.当检测到HER2蛋白且根据ASCO指南HER2蛋白未发生过表达时，用包括有效量的治疗剂曲妥珠单抗Emtansine(T-DM1)的第一治疗方案治疗患者，或

c.在未检测到HER2时，用不包括有效量的T-DM1的第二治疗方案治疗患者。

2.根据权利要求1所述的方法，进一步包括检测Her3蛋白的表达，其中，当检测到HER2的表达且根据ASCO指南HER2未发生过表达，并且Her3被检测到时，使用包括有效量的治疗剂曲妥珠单抗Emtansine(T-DM1)的所述第一治疗方案治疗患者。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中，通过质谱法在肿瘤细胞的蛋白质消化物中检测HER2片段肽来检测HER2蛋白。

4.根据权利要求2或3所述的方法，其中，通过质谱法在肿瘤细胞的蛋白质消化物中检测Her3片段肽来检测HER3蛋白。

5.根据权利要求3或4所述的方法，其中，所述蛋白质消化物包含蛋白酶消化物。

6.根据权利要求5所述的方法，其中，所述蛋白质消化物包括胰蛋白酶消化物。

7.根据权利要求3-6中任意一项所述的方法，其中，质谱法包括串联质谱法、离子阱质谱法、三重四级杆质谱法、MALDI-TOF质谱法、MALDI质谱法、混合离子阱/四级质谱法和/或飞行时间质谱法。

8.根据权利要求3-7中任意一项所述的方法，其中，所使用的质谱法的模式为选择反应监测(SRM)、多重反应监测(MRM)、平行反应监测(PRM)、智能选择反应监测(iSRM)和/或多重选择反应监测(mSRM)。

9.根据上述权利要求中任意一项所述的方法，其中，所述肿瘤细胞来自固体组织。

10.根据权利要求9所述的方法，其中，所述肿瘤样品是福尔马林固定的固体组织。

11.根据权利要求10所述的方法，其中，所述组织是石蜡包埋的组织。

12.根据权利要求3-11中任意一项所述的方法，其中，从HER2蛋白中检测独特的片段肽或多个独特的片段肽包括：通过与已知量的加标内标肽进行比较，检测和/或确定来自所述样品的HER2蛋白中独特的片段肽或多个独特的片段肽的定量水平，其中，生物样品中的天然肽和内标肽都对应于相同的来自HER2蛋白的独特的片段肽或多个独特的片段肽的氨基酸序列。

13.根据权利要求3-12中任意一项所述的方法，其中，所述内标肽或多个内标肽是同位素标记的肽。

14.根据权利要求13所述的方法，其中，所述同位素标记的内标肽或多个内标肽包括选自¹⁸O、¹⁷O、¹⁵N、¹³C、²H或其组合中的一种或多种的重稳定同位素。

15.根据权利要求3-14中任意一项所述的方法，其中，检测和定量来自HER2蛋白中独特的片段肽或多个独特的片段肽与检测和定量来自其它蛋白质的其他肽以多通路形式相结合，使得将何种药物用于治疗的治疗决定是基于检测和/或定量生物样品中来自HER2蛋白以及其他肽/蛋白质的组合中的独特的片段肽或多个独特的片段肽的。