[发明专利]一种多重逆转录聚合酶链式反应检测试剂缓冲液及其应用在审
申请号: | 201811612246.9 | 申请日: | 2018-12-27 |
公开(公告)号: | CN111378730A | 公开(公告)日: | 2020-07-07 |
发明(设计)人: | 王进;吴梦华;石亦静;应彩红;杨聂 | 申请(专利权)人: | 苏州旷远生物分子技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6876 | 分类号: | C12Q1/6876 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 汪旭东 |
地址: | 215500 江苏省苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多重 逆转录 聚合 链式反应 检测 试剂 缓冲液 及其 应用 | ||
本发明属于生物医学临床分子检测领域,具体涉及一种应用于荧光PCR平台的多重逆转录聚合酶链式反应检测试剂的缓冲液及其应用。其特征在于所述缓冲液中包含PCR反应增强剂二甲基亚砜、稳定剂海藻糖。本发明优化了RT‑PCR实验的PCR缓冲液,特别是加入了一定剂量的PCR反应增强剂和稳定剂,对于一步法RT‑PCR反应中的逆转录反应效率和DNA扩增检测反应效率有很大程度的提高,能够同时满足RNA逆转录反应和荧光PCR反应的高效率进行。
技术领域
本发明属于生物医学临床分子检测领域,具体涉及一种应用于荧光PCR平台的多重逆转录聚合酶链式反应检测试剂的缓冲液及其应用。
背景技术
RT-PCR(reverse transcription PCR,逆转录PCR,或称为反转录PCR),是聚合酶链式反应的一种广泛应用的变性。在RT-PCR过程中,一条RNA链被逆转录称为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。RT-PCR的关键步骤是RNA的反转录,要求RNA模板为完整的且不含DNA、蛋白质等杂质。常用的反转录酶有两种,即鸟类成随细胞性白细胞病毒(avianmyeloblastosis virus,AMV)反转录酶和莫罗尼鼠类白血病病毒(moloney murineleukemia virus,MMLV)反转录酶。
RT-PCR通常有一步法RT-PCR和两步法RT-PCR两种方法,一步法RT-PCR操作简便,RT和PCR之间无需开管,能够减少污染的可能性,RT过程得到的cDNA产物全部用于PCR扩增,使得一步法的灵敏度更高,但是单管反应是RT和PCR都不能够在最佳反应条件下进行并且容易相互干扰;两步法RT-PCR方法种,RT和PCR分别在最优的条件下进行使两个反应充分发挥各自的特点,更为灵活且严谨,适合对付未知模板或者较为困难的模板。
PCR反应增强剂和稳定剂常见的有:二甲亚砜(DMSO)、甘油、牛血清白蛋白(BSA)、甲酰胺、非离子去污剂、聚乙二醇6000、亚精胺、硫酸铵、甜菜碱(Betaine)和海藻糖(Trehalose)中的一种或多种,它们对PCR反应的影响虽然有所不同,但都可提高PCR的扩增效率。其中,1%-10%二甲亚砜能改变引物模板配对反应的熔解温度,从而改善GC含量高的DNA的变性情况,使聚合酶更容易在二级结构处延伸,但当浓度高时(大于10%)时会降低保真性。5%-20%甘油可提高产量,增加酶的稳定性。0.1μg/μl-1μg/μl牛血清白蛋白能提高PCR反应的效率,同时减少体系中PCR抑制物对反应的影响。1.25%-10%甲酰胺可促进某些“引物-模板”退火,降低带有二级结构的DNA的变性温度。硫酸铵能增加反应体系的离子强度,改变DNA的变性及退火温度,调节酶活。0.5-2M甜菜碱有助于高GC含量和长DNA片段的PCR反应。2%-5%海藻糖可作为PCR增强剂,通过降低DNA双链融解温度,维持Taq DNA聚合酶稳定性,提高PCR反应效率,可作为酶稳定剂,维持酶的活性及热活化后的酶活性。可中和抑制剂对DNA聚合酶的抑制作用,维持PCR扩增效率。可以根据实际需要,选择其中的一种或多种。
发明内容
本发明提供了一种多重逆转录聚合酶链式反应检测试剂缓冲液,以一步法RT-PCR为方法基础,针对可能的影响因素采取相应的措施,设计了一种RT-PCR缓冲液。
本发明特征在于:优化了RT-PCR实验PCR反应缓冲液,特别是加入了一定剂量的PCR反应增强剂DMSO、稳定剂海藻糖。对于一步法RT-PCR反应中的逆转录反应效率和DNA扩增检测反应效率有很大程度的提高,能够同时满足RNA逆转录反应和荧光PCR反应的高效率进行。
本发明提供一种多重逆转录聚合酶链式反应检测试剂缓冲液,包括Tris盐、硫酸铵、氯化镁和氯化钾的水溶液,所述缓冲液pH值为8.0~10.0,所述缓冲液中Tris盐、硫酸铵、氯化镁和氯化钾的浓度分别为50~100mM、10~50mM、1.0~5.0mM和25~100mM。更优选的,所述缓冲液pH值为9.2,所述缓冲液中Tris盐、硫酸铵、氯化镁和氯化钾的浓度分别为75mM、20mM、3mM和80mM。
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