[发明专利]一种鼻咽癌乏氧微环境影像组学研究模型建立方法在审
| 申请号: | 201811561768.0 | 申请日: | 2018-12-20 |
| 公开(公告)号: | CN109636901A | 公开(公告)日: | 2019-04-16 |
| 发明(设计)人: | 张水兴;张斌;黄文慧;陈秋颖 | 申请(专利权)人: | 暨南大学附属第一医院(广州华侨医院) |
| 主分类号: | G06T17/00 | 分类号: | G06T17/00;G01B11/02 |
| 代理公司: | 北京华仲龙腾专利代理事务所(普通合伙) 11548 | 代理人: | 李静 |
| 地址: | 510000 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 肿瘤 粒级 模型建立 鼻咽癌 密实度 微环境 影像组 粒径 技术支持 立体视觉 三维重建 实际状况 肿瘤模型 混配 级配 粒形 研究 优化 | ||
1.一种鼻咽癌乏氧微环境影像组学研究模型建立方法,其特征在于,具体包括以下步骤:
S1、使用多目立体视觉对肿瘤肿瘤进行三维重建;
S2、提取肿瘤几何信息,对步骤S1中获取的肿瘤重建模型提取肿瘤几何信息,包括肿瘤肿瘤的长L、宽W、厚H、体积V;对于任一肿瘤,使用一垂直于肿瘤长轴的平面Pi,按照0.01mm为步距,逐步剖切肿瘤模型,计算剖面Pi上点云坐标ximin、ximax,zimax、zimin,Pi平面处的宽Wi=ximax-ximin,Hi=zimax-zimin;对于所有的平面P,取Wi、Hi最大值作为肿瘤的宽W、厚H;对于肿瘤长度L,使用垂直于肿瘤中轴的平面,按照0.01mm的步距,逐步切割肿瘤模型;肿瘤长度L计算参见宽W、厚H的计算;对于肿瘤体积V,所使用的图像处理库中内置方法计算得到;
S3、肿瘤肿瘤分级、存储,根据肿瘤三维尺寸,计算肿瘤肿瘤所属粒级d,计算球度S;对于肿瘤i,其肿瘤长为Li,宽为Wi,厚为Hi,其球度Si计算方式如下:
将该肿瘤几何信息、球度存入该粒级d对应的集合Gd中。最后将所有的Gd合并为总的集合G。
S4、肿瘤堆积模拟计算。
2.根据权利要求1所述的鼻咽癌乏氧微环境影像组学研究模型建立方法,其特征在于,肿瘤堆积模拟计算包括以下步骤:
A1、首先创建堆积模拟容器;假定堆积容器体积V,肿瘤各肿瘤体积为Vi,则堆积模拟容器体积与肿瘤样本堆积体积之比n见下式:
A2、生成等效球体集合Geq,使用步骤S3中获取的集合G或某个粒级d的集合Gd,生成等效球的集合Geq;当计算肿瘤整体的密实度时,使用肿瘤整体集合G,计算肿瘤某个粒级d的密实度时,使用集合Gd;等效球按照体积等效的原则来计算;假定某个肿瘤体积为Vi,则该肿瘤的等效球体积为Vi,球度为Si,等效半径Ri,重合系数为首先将要进行堆积模拟的G或Gd的每个肿瘤转换成等效球体,将等效球体的半径、体积、球度存入集合G′中;根据A1中求得的n,将G′复制n+3倍,生成等效球体集合Geq;其中
A3、随机选取球体Bi,其半径为Ri,体积为Vi,球度为Si;
A4、随机生成放置坐标(xi,yi,zi),其中Ri≤xi≤150,Ri≤yi≤150,Ri≤zi≤150;
A5、判断球体Bi放置于(xi,yi,zi)处,与已放置完成的球体是否全都满足重合条件,重合条件入下式:
A6、若球体满足Bi满足重合条件,则将球体Bi放置于(xi,yi,zi),将其数据存入集合Gp,进入步骤A7,若不满足,则跳至步骤A8;
A7、判断是否达到堆积模拟停止条件,若达到停止条件,进入步骤A9,若不满足,则跳至步骤A3;
A8、判断等效球体Bi是否达到跳过条件;这里设置的条件为尝试放置2000次;若2000次生成的坐标均不能满足放置需求,则跳过该球体即跳入步骤A3,若未到达跳过条件,则跳入步骤A4;
A9、肿瘤下降;对于Gp中的所有球体进行下落模拟;首先先生成一个空的球体集合G′p,给Gp中的球体Bi一个向下的方向,当其与容器底部相接触或与G′p中任一球体达到接触条件时,该球体停止下降,将该球体当前位置及球体数据存入集合G′p中;对Gp中的所有球体依次进行,生成新的球体集合G′p;此时的接触条件如下式所示:
A10、创建测量容器,容器的体积V,容器内各个球体的体积Vi,对于被Z=100mm平面分割的球体,其位于Z=100mm以下的体积Vi′计算式如下,其中Hi为球体位于Z=100mm以上的高度,Ri为球体半径;计算测量容器内的球体体积之和Vsum,其中对于被Z=100mm平面分割的球体,其体积Vi取为Vi′。
Vsum=∑Vi;
则密实度γ=Vsum/V。
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