[发明专利]检测DMD基因缺失突变的基因片段在审
申请号: | 201811313186.0 | 申请日: | 2018-11-06 |
公开(公告)号: | CN109486936A | 公开(公告)日: | 2019-03-19 |
发明(设计)人: | 钟敏;潘速跃;李伟 | 申请(专利权)人: | 南方医科大学南方医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 胡辉 |
地址: | 510515 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因片段 缺失突变 肌营养不良 假肥大型 应用 分子病理机制 疾病发生 位点定位 内含子 检测 测序 扩增 制备 断裂 诊断 研究 | ||
本发明公开了检测DMD基因缺失突变的基因片段,在相应内含子上的断裂位点定位后,对DMD基因缺失突变的基因片段进行扩增并测序,本发明具有准确性高、特异性好,重复性好的优点,可应用在制备诊断假肥大型肌营养不良产品中的应用,有利于在临床实践中推广应用;本发明为一段全新的DMD基因缺失突变的基因片段,该片段的结构特征对假肥大型肌营养不良疾病发生的分子病理机制研究具有有益应用。
技术领域
本发明属于核酸检验领域,关于检测DMD基因缺失突变的基因片段。
背景技术
DMD基因又名dystrophin(抗肌萎缩蛋白)基因,是迄今为止发现的人类最大基因,由于DMD基因结构十分巨大,内部情况高度复杂。其定位于Xp21.2区域,跨越基因组序列约2500kb,比其它基因平均大90倍,约占整个人类基因组的0.1﹪,或约占X染色体长度的1.5%。DMD基因的cDNA长14kb,编码区包括79个外显子和7个组织特异性启动子,其余99%的序列由庞大的78个内含子所占据。
DMD基因的突变率高,突变类型包括重复、小缺失、插入、点突变、拼接突变等,大部分可以导致密码子的提前终止。其中大片段缺失是其最主要的突变类型,约占所有突变的65%。因此DMD基因缺失突变是导致临床常见的致死性伴性遗传病假肥大型肌营养不良症(DMD/BMD)的主要原因。
DMD基因大片段缺失还涉及到基因重组(recombination)的问题。重组共有的特征是DNA双螺旋之间的遗传物质发生交换,可以造成大范围序列重排,从而导致DMD基因部分结构发生变化。DMD基因大片段缺失突变后大都通过异常重组(illegitimaterecombination,IR)进行序列重排。在进行DNA双链重组修复过程中,绝大多数DMD基因断裂缺失都是以非同源末端连接(non-homologous end joining,NHEJ)机制进行修复,即修复时两个分子的末端不需要有同源性就能连接起来。
由于DMD基因结构非常庞大,定位和克隆DMD基因缺失连接片段非常困难,若发现一种用于检测DMD基因缺失连接片段序列,它对于DMD/BMD的疾病研究具有意义。
发明内容
本发明的目的之一在于检测DMD基因缺失突变的基因片段。
本发明所采取的技术方案是:
一种用于检测DMD基因缺失突变的基因序列,所述的序列如SEQ ID NO.3所示。
检测上述所述的SEQ ID NO.3序列的试剂在制备诊断假肥大型肌营养不良产品中的应用。
进一步的,所述的检测SEQ ID NO.3所示序列的试剂为检测SEQ ID NO.3所示序列的引物。
进一步的,所述引物的核苷酸序列为:
D07-F:5’-TGAATAGACCTAACACAAACACAGA-3’;
D07-R:5’-AGCTCCTAAGAAGAAATCCGGT-3’。
一种用于检测DMD基因缺失突变的试剂盒,该试剂盒含有检测上述所述序列的试剂。
进一步的,所述的检测所述序列的试剂为检测SEQ ID NO.3所示序列的引物。
进一步的,所述的引物的核苷酸序列为:
D07-F:5’-TGAATAGACCTAACACAAACACAGA-3’;
D07-R:5’-AGCTCCTAAGAAGAAATCCGGT-3’。
本发明的有益效果是:
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