[发明专利]酵母DNA的保真存储方法在审

专利信息
申请号: 201811249175.0 申请日: 2018-10-25
公开(公告)号: CN109402111A 公开(公告)日: 2019-03-01
发明(设计)人: 宁康;李锐豪;陈超云;朱雪 申请(专利权)人: 华中科技大学鄂州工业技术研究院;华中科技大学
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙) 42231 代理人: 黄君军
地址: 436044 湖北*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 离心管 紫外光 酵母DNA 上层 混合液 振荡 保真 混匀 氯仿 冷冻 存储 饱和苯酚 酵母样本 离心清洗 时间选择 信息存储 重悬菌体 提取DNA 保真度 玻璃珠 保存 补加 冷藏 损伤
【说明书】:

发明提供了酵母DNA的保真存储方法,包括:将酵母样本溶液,用TE缓冲液重悬菌体,离心清洗,加玻璃珠,Tirs饱和苯酚,得到的混合液振荡5‑10min,冷冻,离心;吸取上层水相转移至一个新的离心管中,加TE、氯仿混匀后冷藏,离心;转移上层水相至一个新的离心管中,补加TE和RNase消化,加入氯仿混匀,冷冻,离心;转移上层水相至一个新的离心管中即可;于紫外光下、温度为15℃~25℃、pH为7~8的条件下保存。本发明提取DNA时混合液振荡时间选择5‑10min,并选择于紫外光下、温度为15℃~25℃、pH为7~8的条件下保存,DNA所受的影响或损伤最小,保真度最高,解决了大规模信息存储问题。

技术领域

本发明涉及DNA材料存储研究技术领域,尤其涉及酵母DNA的保真存储方法。

背景技术

最初的生物计算技术是利用海量DNA序列的排列组合,解决NP-hard等问题。其核心技术,是基于小体积内DNA核苷酸数量巨大的特点,利用DNA核苷酸之间配对的特性,通过核苷酸穷举配对的方法解决大规模的排列组合问题,从而达到解决NP-hard问题的目的。而新一代的生物计算技术已经涉及到基本计算和逻辑模块的构建和整合。其中最显著的两个方向就是电子细胞和合成生物学:电子细胞的概念是基于对细胞内基因等表达和调控原件的深入认知,构建对人造环境的反应完全正常的电子化细胞;而合成生物学则更进一步,通过结合细胞生物学和基因工程技术,利用模块化合耦合设计等方法,尝试构建全新的、多功能的生物体。

随着生物计算技术的发展,相关领域对生物存储技术的要求也越来越高。生物存储技术不但可以作为存储平台直接支撑上述电子细胞和合成生物学等生物计算相关研究,还将可以应用到更为广阔的通用信息存储等领域。具体而言,当前任何文本、图像和语音等信息均可以被数字化为0、1组成的基本信息,而这些0、1等基本信息是可以被转化成特定的字符信息(如字母表等)的。在另一方面,DNA核苷酸(A、C、G、T)本身在表达上是由有限的字母组成。因此,将0、1等基本信息映射到DNA核苷酸组成的序列上是十分自然的思路。因此,利用DNA存储所有类型的信息在理论上是可行的(Goldman N,Bertone P, Chen S,et al.,2013;Yang L,Nielsen AAK Nielsen,Fernandez-Rodriguez J,et al., 2016.)。

然而,利用DNA存储信息的核心问题之一是如何对DNA存储材料进行保存,即保存DNA的物化条件的选择与组合。一般情况下,保存DNA的方法为 -80℃冰箱保存。这种保存方法DNA会受的影响或损伤,保真度不高,且在大规模信息保存中并不现实,也不方便频繁的存取。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术之缺陷,提供了酵母DNA的保真存储方法,提取DNA时混合液振荡时间选择5-10min,并选择于紫外光下、温度为15℃~ 25℃、pH为7~8的条件下保存,DNA所受的影响或损伤最小,保真度最高,解决了大规模信息存储问题。

为实现上述目的,本发明是这样实现的:

本发明的目的在于提供了酵母DNA的保真存储方法,包括如下步骤:

步骤1、珠磨法提取样本中的DNA:将酵母样本溶液于离心管离心,用TE 缓冲液重悬菌体,离心清洗,收集的菌体用TE缓冲液悬起后加玻璃珠,再加 Tirs饱和苯酚,得到的混合液振荡5-10min,冷冻,离心;吸取上层水相转移至一个新的离心管中,加TE缓冲液、氯仿混匀后冷藏,再离心;转移上层水相至一个新的离心管中,补加TE缓冲液和RNase消化,加入氯仿混匀,冷冻,离心;转移上层水相至一个新的离心管中,至此,上层水相中即含有纯化好的酵母基因组DNA;

步骤2、将纯化好的酵母基因组DNA于紫外光下、温度为15℃~25℃、pH 为7~8的条件下保存。

本发明具有的有益效果是:

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