[发明专利]喜盐芽胞杆菌钠/氢逆向转运蛋白基因sdmlT及鉴定有效

专利信息
申请号: 201810765939.5 申请日: 2018-07-12
公开(公告)号: CN109055397B 公开(公告)日: 2020-04-24
发明(设计)人: 姜巨全;孟琳;王艳红;徐桐;张正来;刘贺男;张伟 申请(专利权)人: 东北农业大学
主分类号: C12N15/31 分类号: C12N15/31;C07K14/32;C12N15/70;C12N15/90;C12N1/21;C05F11/08;C12N15/82;C12R1/19
代理公司: 成都东恒知盛知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 51304 代理人: 何健雄
地址: 150030 黑龙*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 喜盐芽胞 杆菌 逆向 转运 蛋白 基因 sdmlt 鉴定
【权利要求书】:

1.一种喜盐芽胞杆菌钠/氢逆向转运蛋白基因sdmlT,其特征在于,所述喜盐芽胞杆菌钠/氢逆向转运蛋白基因sdmlT是一个完整开放阅读框ORF,ORF的核苷酸序列为SEQ IDNO.1;

利用所述喜盐芽胞杆菌钠/氢逆向转运蛋白基因sdmlT编码的蛋白SdmlT,氨基酸序列为SEQ ID NO.2;

所述蛋白SdmlT由442个氨基酸残基组成,并且具有Na+(Li+、K+)/H+逆向转运蛋白活性,所述活性具有pH依赖性。

2.一种如权利要求1所述喜盐芽胞杆菌钠/氢逆向转运蛋白基因sdmlT的鉴定方法,其特征在于,所述鉴定方法包括以下步骤:

(1)通过基因文库和功能互补相结合的方法,选取安达喜盐芽孢杆菌作为分离耐盐碱基因的供体,利用盐敏感缺陷株E.coli KNabc的生理特性,以0.2M NaCl的氨苄抗性固体培养基作为筛选工具,首先得到含有耐盐碱基因的片段;

(2)利用生物信息学软件对基因片段进行分析,确定耐盐碱的基因,通过PCR扩增得到sdmlT基因,该基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;构建含有sdmlT基因的原核表达载体;

(3)通过基因功能互补的方法,首先对该基因的生理功能进行鉴定;再通过荧光猝灭技术手段,对sdmlT基因编码的蛋白功能进行鉴定。

3.如权利要求2所述的鉴定方法,其特征在于,所述构建含有sdmlT基因的原核表达载体为构建pET19-sdmlT原核表达载体,构建方法包括:

根据sdmlT基因序列,首先利用Primer5软件设计特性引物sdmlT-F、sdmlT-R特异引物,并在基因的5’和3’端分别引入Nde I、BamH I两个酶切位点,然后进行sdmlT的PCR扩增;

引物sdmlT-F、sdmlT-R序列为:

sdmlT-F:CATATGATGTCCAGTTCAGCTGAAAG

sdmlT-R:GGATCCTTACATTAGCAACGGAATAA

将PCR扩增产物末端加“A”后连入pEASY-T3载体,将其转化到Trans1-T1感受态细胞中,进行蓝白斑筛选出亚克隆;再用Nde I、BamH I两种内切酶处理连有sdmlT的pEASY-T3-sdmlT,并同时对空载体pET19b做相同处理,对处理后的空载体pET19b和sdmlT片段进行连接,通过热激法将构建好的表达载体pET19-sdmlT导入异源表达宿主E.coli KNabc中,导入方法具体如下:

取E.coli KNabc感受态细胞,向其中加入适量的pET19-sdmlT重组质粒,轻轻混匀,冰浴30min;然后将盛有上述混合物的离心管置于42℃水浴中热激90s;之后快速移至冰浴,放置10min;再将入37℃预热的新鲜培养基进行复苏45min;最后,取适当体积均匀涂布在含有氨苄抗性的LBK培养基上;

所述荧光猝灭技术手段,包括:以吖啶橙AO作为荧光探针,检测荧光猝灭及恢复情况;向盛2.5mL缓冲液B的石英杯中加入2μM荧光探针吖啶橙AO和40μg的反转膜,抽吸混匀;再加入终浓度为5mM的Tris-D-乳酸并混匀反应体液;乳酸作为底物,通过呼吸链产生跨膜pH梯度ΔpH,此时荧光强度已开始下降;利用荧光分光光度计来监控跨膜pH梯度的变化;

荧光监控参数设置:激发光EX波长492nm,发射光EM波长526nm;当荧光强度下降至稳定状态时,向反应体系加入终浓度为5mM的NaCl、KCl、LiCl,以破坏pH梯度ΔpH,此时荧光强度开始升高;根据荧光强度的恢复程度判断并表示Na+(Li+,K+)/H+逆向转运蛋白活性的有无及大小。

4.一种如权利要求1所述喜盐芽胞杆菌钠/氢逆向转运蛋白基因sdmlT,其特征在于,所述该蛋白SdmlT使肠杆菌K12 dctA基因敲除突变株进行Na+(Li+、K+)/H+逆向转运。

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