[发明专利]基于RT-LAMP检测SFTSV的引物组及试剂盒在审
申请号: | 201810683300.2 | 申请日: | 2018-06-28 |
公开(公告)号: | CN108754029A | 公开(公告)日: | 2018-11-06 |
发明(设计)人: | 张瑞玲;张忠;苑广盈;王丽 | 申请(专利权)人: | 泰山医学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 成都方圆聿联专利代理事务所(普通合伙) 51241 | 代理人: | 李鹏 |
地址: | 271016 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核苷酸序列 环引物 外引物 内引物FIP 快速检测 试剂盒 发热伴血小板减少综合征病毒 试剂盒操作 血小板减少 综合症病毒 内引物BIP 寡核苷酸 灵敏度 引物组 发热 观察 | ||
本发明公开了基于RT‑LAMP快速检测发热伴血小板减少综合症病毒的寡核苷酸及试剂盒,包括外引物F3和B3、内引物FIP和BIP、环引物LoopF和LoopB,其中:外引物F3的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,外引物B3的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;内引物FIP的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,内引物BIP的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示;环引物LoopF的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示,环引物LoopB的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示。本发明所提供的试剂盒操作简单、灵敏度高、特异性好、成本低廉、反应快速、结果易于观察,可快速检测发热伴血小板减少综合征病毒。
技术领域
本发明属于分子生物学领域,具体涉及一种基于RT-LAMP快速检测发热伴血小板减少综合症病毒的寡核苷酸及试剂盒。
背景技术
发热伴血小板减少综合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)是近年来我国新发现的一类以发热、血小板减少为主要临床特征的病毒性出血热,主要分布在我国中部和东部地区的山区丘陵地带。目前,我国已有16个省份有发热伴血小板减少综合征病例报告。蜱虫叮咬为其主要传播途径,直接接触病人血液和血性分泌物亦可感染该病并导致聚集性疫情发生。该病的病原体为一种新型的布尼亚病毒科、白蛉病毒属病毒,为分节段单股负链RNA病毒,被命名为发热伴血小板减少综合征病毒(Severe feverwith thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)。
发热伴血小板减少综合征早期临床症状不典型,多以发热和胃肠道症状、呼吸道症状为首发表现,不易引起重视。尤其是基层医疗机构普遍缺乏对该病的诊断能力,病例不能得到及时有效的诊断、治疗,导致该病病死率较高,已成为重要的公共卫生问题。目前,实验室主要通过病毒分离、核酸检测、抗原和抗体诊断等技术对SFTSV进行检测。但由于免疫学方法经常造成假阳性,细胞培养方法成本较高、培养时间较长、生物安全要求高、操作技术复杂、PCR技术需要精密昂贵的仪器,对操作人员要求也较高等原因,上述方法难以在基层单位推广。而SFTS多发生于山区和丘陵等医疗卫生条件相对较差的地区,所以迫切需要建立适合基层和现场应用的快速、可靠、不依赖于昂贵仪器设备的检测方法。
发明内容
本发明所要解决的技术问题为:如何提供一种适合基层和现场应用的快速、可靠、不依赖于昂贵仪器设备的SFTS的检测方法。
本发明的技术方案为:基于RT-LAMP快速检测发热伴血小板减少综合症病毒的寡核苷酸,包括外引物F3和B3、内引物FIP和BIP、环引物LoopF和LoopB,其中:
外引物F3的核苷酸序列为:GCACATCATCTCAGGGGGA(如SEQ ID No.1所示),
外引物B3的核苷酸序列为:GGCATCAGGGAAGATGTCAA(如SEQ ID No.2所示);
内引物FIP的核苷酸序列为:
GTGCTGCAGCAGCAGCCTTAACCTTCAGGTTCATGACGGC(如SEQ ID No.3所示),
内引物BIP的核苷酸序列为:
GCGCTACCCTTACAGGGGTGGTTGATGGCACTCCAGGAG(如SEQ ID No.4所示);
环引物LoopF的核苷酸序列为:AGGAGTATCTCCCAGTGGGG(如SEQ ID No.5所示),
环引物LoopB的核苷酸序列为:AGAGCCTGGTCTCTGCCCT(如SEQ ID No.6所示)。
本发明还公开了一种基于RT-LAMP快速检测发热伴血小板减少综合症病毒的试剂盒,包括以下组分:
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