[发明专利]一种人类痛风相关基因突变位点的检测方法及试剂盒在审
申请号: | 201810669871.0 | 申请日: | 2018-06-26 |
公开(公告)号: | CN108977525A | 公开(公告)日: | 2018-12-11 |
发明(设计)人: | 王文忠;胡军;田军龙;陈苏平;卜云璇 | 申请(专利权)人: | 苏州道尔盾基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6872;C12Q1/6806 |
代理公司: | 北京远大卓悦知识产权代理事务所(普通合伙) 11369 | 代理人: | 韩飞 |
地址: | 215000 江苏省苏州*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 痛风 突变位点 相关基因 检测 特异性引物 检测试剂 试剂盒 单碱基延伸反应 特异性PCR扩增 分析目标基因 限制性内切酶 实验自动化 质谱仪检测 基因基因 基因设计 目的片段 人员操作 实验流程 脱盐纯化 基因 核酸 扩增 通量 重性 消化 | ||
1.一种人类痛风相关基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述检测方法包括如下步骤:
(1)针对ABCG2和SLC2A9基因设计特异性引物;
(2)利用特异性PCR扩增出包含ABCG2和SLC2A9基因的目的片段;
(3)利用限制性内切酶消化PCR产物片段;
(4)进行单碱基延伸反应;
(5)进行脱盐纯化处理;
(6)通过核酸质谱仪检测分析目标基因ABCG2和SLC2A9基因的序列。
2.根据权利要求1所述的人类痛风相关基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中设计的特异性引物包括用于扩增ABCG2和SLC2A9基因基因的特异性引物对,所述特异性引物对包含三条ABCG2基因的正向引物S EQ ID Nos:1、SEQ ID Nos:3、SEQ ID Nos:5,和三条ABCG2基因的反向引物SEQ ID Nos:2、SEQ ID Nos:4、SEQ ID Nos:6,以及一条SLC2A9基因的正向引物SEQ ID Nos:7,和一条SLC2A9基因的反向引物SEQ ID Nos:8。
3.根据权利要求1所述的人类痛风相关基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(2)中特异性PCR扩增的反应程序为:98℃热启动,10分钟;95℃变性,30秒;55℃退火,30秒;72℃延伸,30秒;扩增40个循环;72℃终延伸,5分钟。
4.根据权利要求1所述的人类痛风相关基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中的限制性内切酶进行消化处理条件为:37℃消化处理45分钟,85℃加热变性5分钟,冰浴10分钟。
5.根据权利要求1所述的人类痛风相关基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中的限制性内切酶为虾碱性磷酸酶。
6.根据权利要求1所述的人类痛风相关基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(4)中单碱基延伸反应包括ABCG2和SLC2A9基因的单碱基延伸引物,所述ABCG2基因的单碱基延伸引物包含四条单碱基延伸引物SEQ ID Nos:9,SEQ ID Nos:10,SEQ ID Nos:11,SEQ ID Nos:12,所述S LC2A9基因的单碱基延伸引物包含一条单碱基延伸引物SEQ IDNos:13。
7.根据权利要求1所述的人类痛风相关基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(4)中单碱基延伸反应的反应程序为:95℃热启动,1分钟;95℃变性,5秒;56℃退火,5秒;80℃延伸,5秒;扩增40个循环;72℃终延伸,3分钟。
8.根据权利要求1所述的人类痛风相关基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(6)的核酸质谱检测的具体步骤为:
(1)在树脂板上铺好待用树脂,风干5-10分钟;
(2)向样本板的反应孔中加入待测的样本,补充25ul ddH2O,用封口膜密封,3000转/分钟瞬时离心;
(3)除去封口膜,将样本板倒扣在步骤(1)的树脂板上固定,然后将样本板和树脂板一起翻转,使风干的树脂落入样本板的反应孔内,用封口膜密封,3000转/分钟瞬时离心;
(4)将样本板置于旋转器上慢速旋转20分钟,再3000转/分钟离心5分钟,然后点样上机,用核酸质谱仪进行检测。
9.一种人类痛风相关基因突变位点的检测试剂盒,其特征在于,包括用于扩增ABCG2和SLC2A9基因基因的特异性引物对,所述特异性引物对包含三条ABCG2基因的正向引物SEQID Nos:1、SEQ ID Nos:3、SEQ ID Nos:5,和三条ABCG2基因的反向引物SEQ ID Nos:2、SEQID Nos:4、SEQ ID Nos:6,以及一条SLC2A9基因的正向引物SEQ ID Nos:7,和一条SLC2A9基因的反向引物SEQ ID Nos:8。
10.根据权利要求9所述的人类痛风相关基因突变位点的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括ABCG2和SLC2A9基因的单碱基延伸引物,所述ABCG2基因的单碱基延伸引物包含四条单碱基延伸引物SEQ ID Nos:9,SEQ ID Nos:10,SEQ ID Nos:11,SEQ ID Nos:12,所述SLC2A9基因的单碱基延伸引物包含一条单碱基延伸引物SEQ ID Nos:13。
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