[发明专利]检测百合南芥菜花叶病毒的试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201810641534.0 | 申请日: | 2018-06-21 |
公开(公告)号: | CN108754026A | 公开(公告)日: | 2018-11-06 |
发明(设计)人: | 张玉宝;王亚军;谢忠奎;杨果;邱阳;郭志鸿;王乐 | 申请(专利权)人: | 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 730000 *** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 百合 特异性LAMP引物组 南芥菜花叶病毒 检测 阳性对照品 阴性对照品 试剂盒 分子生物学 第一链cDNA 反向内引物 反向外引物 正向环引物 正向内引物 正向外引物 反向引物 反应试剂 合成试剂 恒温水浴 扩增反应 切花百合 荧光染料 种特异性 专业仪器 抗体IgG 提取RNA 标准品 检测液 灵敏度 酶标仪 可用 病毒 扩散 监控 基层 | ||
1.一种特异性检测百合南芥菜花叶病毒ArMV的IC-RT-LAMP试剂盒,包括特异性ArMV抗体IgG、特异性RT反向引物ArMV-R、特异性LAMP引物组、第一链cDNA合成试剂和LAMP扩增反应试剂,所述特异性LAMP引物组包括正向外引物F3、反向外引物B3、正向内引物FIP、反向内引物BIP和正向环引物LF,所述特异性RT反向引物ArMV-R以及LAMP引物组的序列如下:
ArMV-R:5’- AATCATTAGGGAAAGTCG-3’
F3:5’- ACAAAAGTGTGTCCCTTCT-3’
B3:5’- AAACAGTTGATTCCAGTTGTT-3’
FIP:5’- ACCAACACCAAGATAGTAACTCAAATTTGGGCCAAACTCTTGTT-3’
BIP:5’- TGGTCAAGGGCAAAGTGCATATGACCCCATTCCATTCAC-3’
LF:5’- ATGTAGCCCTTGTACTTATGGCA -3’
其特征在于:所述试剂盒还包括ArMV抗体IgG 包被缓冲液(CB)、磷酸缓冲液(PBS)、磷酸洗涤缓冲液(PBST)、SYBR Green I荧光染料检测液、阴性对照品和阳性对照品,所述阴性对照品为ddH2O;所述阳性对照品为切花百合ArMV CP基因标准品;所述阳性对照品序列如下:
切花百合ArMV CP基因标准品:
TACTACCAGTGCCTACAAAAGTGTGTCCCTTCTTTTGGGCCAAACTCTTGTTGATGGGACTCATAAAGTGTATAATTATAATAATACACTTTTGAGTTACTATCTTGGTGTTGGTGGTGTGGTCAAGGGCAAAGTGCATATATGTAGCCCTTGTACTTATGGCATAGTCCTAAGAGTTGTTAGTGAATGGAATGGGGTCACTAACAACTGGAATCAACTGTTTAAATACCCCGGGTGTTATATCGATGAGGATGGGAATTTTGAAATTGAAATTCGTTCCCCATATCATCGAACTCCACTGCGCTTACTGGATGGACAGGCAGCGAGCTCTTTCACGAGCACGCTGAATTTCTATGCAATTTCGGGGCCAATTGCCCCGAGTGGAGAAACTGCTAAGATGCCAGTGGTAGTGCAAATTGACGAAATTGCATTACCAGATCTTTCCGTCCCGACTTTCCCTAATGATT。
2.一种采用如权利要求1所述的特异性检测百合南芥菜花叶病毒的IC-RT-LAMP试剂盒特异性检测百合南芥菜花叶病毒的检测方法,其特征在于:
①抗体制备:制备ArMV病毒CP的基因工程重组蛋白,用其免疫动物,获得特异性的ArMV抗体IgG;
②免疫捕获IC:将步骤①获得的特异性的ArMV抗体IgG包被在反应容器中,特异捕获待测样品中的ArMV粒子;
③反转录RT:以步骤②捕获的ArMV粒子为模板,利用ArMV的特异性RT反向引物ArMV-R和第一链cDNA合成试剂进行反转录RT反应,以此获得第一链cDNA;
④LAMP扩增:以步骤③得到的第一链cDNA作为模板,用LAMP特异性引物组和LAMP扩增反应试剂进行LAMP扩增,并以ddH2O作为阴性对照,以切花百合ArMV CP基因标准品作为阳性对照;
⑤分析判断反应产物:以步骤④中所得LAMP扩增结果判断待测样品中是否含有ArMV。
3.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,步骤①所述ArMV抗体为多克隆抗体或单克隆抗体。
4.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,步骤⑤中根据扩增结果判断待测样品中是否含有ArMV的具体方法为荧光染料肉眼观察法;所述荧光染料肉眼观察法为:取SYBRGreen I 荧光染料反应液加入步骤④所述LAMP扩增的反应产物中,采用肉眼直接观察,若扩增产物出现绿色,说明SYBR Green I染料与双链DNA 结合,则为阳性反应,表示样品中含有ArMV;若扩增产物颜色为橙色则为阴性反应,表示样品中不含ArMV。
5.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,步骤⑤中根据扩增结果判断待测样品中是否含有ArMV的具体方法为琼脂糖凝胶电泳检测技术;所述琼脂糖凝胶电泳检测技术为:将步骤④所述LAMP扩增的反应产物进行琼脂糖凝胶电泳,若扩增产物呈明亮的弥散状核酸泳带,则为阳性反应,表示样品中含有ArMV;若扩增产物无核酸泳带,则为阴性反应,表示样品中不含ArMV。
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