[发明专利]一种Hemi-M甲基化修饰引物及其应用有效
申请号: | 201810638121.7 | 申请日: | 2018-06-20 |
公开(公告)号: | CN108753771B | 公开(公告)日: | 2020-05-12 |
发明(设计)人: | 张晓妮;屈宏越;许明炎;陈实富 | 申请(专利权)人: | 深圳市海普洛斯生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6886;C40B50/06 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 518000 广东省深圳市南山区高*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 hemi 甲基化 修饰 引物 及其 应用 | ||
1.一种对DNA样品进行胞嘧啶保护的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括Hemi-M甲基化修饰引物,所述引物中的胞嘧啶均被甲基化;
其中,所述甲基化修饰包括甲基化和/或羟甲基化修饰;
所述试剂盒还包括dNTP,所述dNTP中的dCTP被mdCTP替代。
2.一种PCR方法,其特征在于,所述方法为:采用权利要求1所述的试剂盒进行PCR扩增反应,对样本DNA链进行胞嘧啶保护;
其中,所述PCR扩增的dNTP中的dCTP被mdCTP替代。
3.根据权利要求2所述的PCR方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应循环数为1-3个循环。
4.一种以非疾病诊断为目的的甲基化文库的构建方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)将DNA样品进行末端修复,3’端加A,甲基化接头连接;
(2)将步骤(1)处理后的产物采用权利要求1所述的试剂盒进行胞嘧啶保护;
(3)将步骤(2)处理后的产物进行重亚硫酸盐处理;
(4)将步骤(3)处理后的产物进行扩增添加索引序列,得到所述甲基化文库;
所述胞嘧啶保护为:
采用SEQ ID NO.1所示的引物对DNA样本链进行PCR扩增反应,且PCR扩增的dNTP中的dCTP被mdCTP替代,PCR扩增的反应循环数为1-3个循环。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述的DNA样品为gDNA,所述方法还包括对DNA样品进行片段化处理的步骤。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)之前还包括引入标签的步骤。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述标签的结构为反向互补,正链3’端突出,5’端未被磷酸化,负链5’端被磷酸化。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述3’端突出为悬突胸腺嘧啶。
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述标签含有鸟嘌呤和胞嘧啶,且与甲基化修饰引物结合于同一条DNA链上,且标签序列中所有的胞嘧啶全部被甲基化修饰;
其中,引入所述标签的方法为:将所述标签引入到DNA片段两端。
10.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述标签为一条寡核苷酸退火形成的茎环结构,且3’端突出,5’端磷酸化。
11.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述标签为两条寡核苷酸退火形成两端或一端互补配对,且3’端突出,5’端磷酸化。
12.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,引入所述标签的方法为:将所述标签引入到DNA片段两端,经过处理后形成5’端突出,延伸后形成两端为平末端带标签的DNA片段。
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