[发明专利]一种与谷子旗叶长性状相关的SNP标记及其检测引物和应用有效
| 申请号： | 201810340251.2 | 申请日： | 2018-04-16 |
| 公开（公告）号： | CN108707684B | 公开（公告）日： | 2021-12-21 |
| 发明（设计）人： | 赵治海;王晓明;李双东;赵芳;张耕耘;范光宇;宋国亮;裴晶晶;张雅莉 | 申请（专利权）人： | 张家口市农业科学院 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人： | 李小焦;彭家恩 |
| 地址： | 075032 河北省张家口市*** | 国省代码： | 河北;13 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 谷子 旗叶长 性状 相关 snp 标记 及其 检测 引物 应用 | ||
1.一种SNP标记在谷子旗叶长预测、谷子旗叶长早期鉴定或谷子旗叶长性状方面的分子辅助筛选育种中的应用；
所述SNP标记为Seq ID No.1所示序列，具有自Seq ID No.1所示序列5’端起第37位碱基为C或G的SNP位点；所述SNP位点位于第二条染色体第39221591bp至第39480016bp的bin标记内，且与谷子旗叶长紧密连锁；所述SNP位点位于第二条染色体的序列第39309061bp位置。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：对SNP位点，利用复合区间作图法，采用5%的总体显著水平，QTL检测的LOD值为3.4857，表型变异解释率为3.08%。
3.一种引物对在谷子旗叶长预测、谷子旗叶长早期鉴定或谷子旗叶长性状方面的分子辅助筛选育种中的应用；
所述引物对的上游引物为Seq ID No.2所示序列，下游引物为Seq ID No.3所示序列；
Seq ID No.2：5’- GCCGTCTGAATGATGGTGC -3’；
Seq ID No.3：5’- AGGTGGACTGCGAGCTGAA -3’；
所述引物对用于检测SNP标记，所述SNP标记为Seq ID No.1所示序列，具有自Seq IDNo.1所示序列5’端起第37位碱基为C或G的SNP位点；所述SNP位点位于第二条染色体第39221591bp至第39480016bp的bin标记内，且与谷子旗叶长紧密连锁；所述SNP位点位于第二条染色体的序列第39309061bp位置。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：对SNP位点，利用复合区间作图法，采用5%的总体显著水平，QTL检测的LOD值为3.4857，表型变异解释率为3.08%。
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