[发明专利]一种位于CEP128基因的与放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物及其应用

说明书

本发明公开了CEP128基因上的SNP位点作为与肿瘤放疗引起的放射性脑损伤发病风险相关的标志物的应用或在制备预测肿瘤放疗引起的放射性脑损伤发病风险的试剂盒中的应用。同时，制备得到一种预测肿瘤放疗引起的放射性脑损伤发病风险的试剂盒，利用该试剂盒检测SNP标志物分型，联合患者临床信息可以更加全面准确的评估鼻咽癌患者发生放射性脑损伤的患病风险。将本发明运用于临床中，针对高危患者提前采取保护措施，有助于实现患者的个体化治疗，提高鼻咽癌患者的长期生存质量。同时，可以为其他放疗引起的正常组织损伤的风险预测提供方法和策略上的借鉴。

技术领域

本发明涉及基因工程和肿瘤学技术领域，更具体地，涉及一种位于CEP128基因的与放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物及其应用。

背景技术

放疗是鼻咽癌首选的治疗方式，而放疗引起的放射性脑损伤是鼻咽癌患者最严重的晚期不良反应之一。该不良反应往往具有不可逆性，其临床症状包括头晕、头痛、记忆下降、认知功能障碍等，极大地影响患者的生活质量。放射性脑损伤一旦发生，治疗颇为困难，临床上一般给予激素、神经节苷脂或胞二磷胆碱等药物治疗，或者高压氧或手术治疗。近年来发现贝伐单抗和神经生长因子也有一定的疗效。这些治疗方式大多数只能一定程度上缓解患者的症状，而且部分药物长期使用将可能引起其他的不良反应。因此，对接受放疗的鼻咽癌患者进行放射性脑损伤发病风险预测，对高危个体提前采取针对性的保护措施，实现鼻咽癌的个体化治疗，显得尤为重要。

研究表明，多种临床因素与放射性脑损伤的发病风险相关，例如，放疗剂量、肿瘤分期、放疗技术等。然而，在相同的临床因素和治疗手段下，放射性脑损伤的发生及严重程度在不同的病人中仍具有很大差异，这提示，遗传因素可能是放射性脑损伤发生的重要内因。

目前的研究发现，单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism, SNP）是引起正常组织放射性损伤的重要遗传因素。关于放疗引起的正常组织损伤的遗传易感性研究分为候选基因研究和全基因组关联研究。候选基因研究重点关注了DNA损伤修复、细胞周期、炎症反应等通路上的基因在放疗引起的皮肤纤维化、消化道黏膜反应、勃起功能障碍、放射性食管炎和放射性肺炎等早期/晚期副反应中的作用；而全基因组关联研究成功揭示了与乳腺癌和前列腺癌急性/晚期不良反应显著相关的易感位点。这些发现提示我们，遗传因素在放射敏感性的个体差异中起到了重要的作用。

然而，目前关于放射性脑损伤的相关遗传学研究还未见报道。若能筛选出与放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP位点，并研制出相应的诊断试剂盒，将可以对放射性脑损伤高危病人进行预测和提前干预，同时还可以推广应用到除了鼻咽癌之外的其他接受治疗性或预防性放疗的肿瘤，提高肿瘤病人的生活质量。

发明内容

本发明的目的是为了克服现有技术的不足，提供位于CEP128基因的与放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物及其检测方法。

本发明的第一个目的是提供CEP128基因上的SNP位点作为与肿瘤放疗引起的放射性脑损伤发病风险相关的标志物的应用或在制备预测肿瘤放疗引起的放射性脑损伤发病风险的试剂盒中的应用。

本发明的第二个目的是提供一对用于检测以上所述的任一SNP位点的特异性扩增引物。

本发明的第三个目的是提供一对用于检测以上所述的任一SNP位点的特异性探针。

本发明的第四个目的是提供一对用于检测以上所述的SNP位点rs162171的特异性扩增引物。

本发明的第五个目的是提供一对用于检测以上所述的SNP位点rs162171的特异性探针。

本发明的第六个目的是提供一对用于检测以上所述的SNP位点rs17111237的特异性扩增引物。