[发明专利]抗病转基因大豆事件B5B9104-3外源插入片段侧翼序列及其应用有效
申请号: | 201810138923.1 | 申请日: | 2018-02-03 |
公开(公告)号: | CN108239641B | 公开(公告)日: | 2021-08-13 |
发明(设计)人: | 牛陆;杨向东;董英山;邢国杰;杨静;贺红利;郭东全;钱雪燕;姚瑶 | 申请(专利权)人: | 吉林省农业科学院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6895 |
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地址: | 130033 吉*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 抗病 转基因 大豆 事件 b5b9104 插入 片段 侧翼 序列 及其 应用 | ||
1.广谱抗花叶病毒转基因大豆事件B5B9104-3外源插入片段左边界和右边界侧翼序列,其特征在于,外源插入片段左边界侧翼序列如SEQ-2所示,外源插入片段右边界侧翼序列如SEQ-3所示,由来源于大豆基因组序列和来源于外源插入片段序列组成的DNA序列;其中:
外源插入片段左边界侧翼序列特征包括:
(1)SEQ-2第1-480位点序列来源于栽培大豆品种沈农9号基因组序列;
(2)SEQ-2第481-1200位点序列来源于外源插入片段序列;
外源插入片段右边界侧翼序列特征包括:
(1)SEQ-3第1-582位点序列来源于外源插入片段序列;
(2)SEQ-3第583-1294位点序列来源于栽培大豆品种沈农9号基因组序列。
2.权利要求1所述外源插入片段左、右边界侧翼序列的制备方法,其特征在于,提取转基因大豆事件B5B9104-3基因组DNA,利用基因组重测序技术分析确定外源片段插入位点,并通过PCR扩增获得。
3.权利要求1所示侧翼序列在建立转基因大豆事件B5B9104-3特异性检测方法或制备检测试剂盒中的应用,其特征在于,依据权利要求1所示侧翼序列,制备特异性引物或探针。
4.权利要求1所述侧翼序列、权利要求3所述特异性检测方法或检测试剂盒在转基因大豆事件B5B9104-3检测中的应用,其中,检测对象包括亲本、衍生品系或品种,及其制品或产品。
5.权利要求3或权利要求4所述特异性检测方法,其特征在于,其中一条引物为依据SEQ-2第1-480位点序列设计的正向引物,另一条引物为依据SEQ-2第481-1200位点序列设计的反向引物,即所述两条引物组合为权利要求1所述外源插入片段左边界侧翼序列特异性检测引物。
6.权利要求3或权利要求4所述试剂盒,其特征在于,其中一条引物为依据SEQ-2第1-480位点序列设计的正向引物,另一条引物为依据SEQ-2第481-1200位点序列设计的反向引物,即所述两条引物组合为权利要求1所述外源插入片段左边界侧翼序列特异性检测引物。
7.根据权利要求5所述外源插入片段左边界侧翼序列特异性检测引物,其特征在于:如SEQ-4和SEQ-5所示:
所述正向引物SEQ-4为:5’-GAAAAAACACATTATTCCATGTGGAGAAG-3’
所述反向引物SEQ-5为:5’-TGAGCAACTTGAAATGATTTCAGAAACTTC-3’。
8.权利要求3或权利要求4所述特异性检测方法,其特征在于,其中一条引物为依据SEQ-3第1-582位点序列设计的正向引物,另一条引物为依据SEQ-3第583-1294位点序列设计的反向引物,即所述两条引物组合为权利要求1所述外源插入片段右边界侧翼序列特异性检测引物。
9.权利要求3或权利要求4所述检测试剂盒,其特征在于,其中一条引物为依据SEQ-3第1-582位点序列设计的正向引物,另一条引物为依据SEQ-3第583-1294位点序列设计的反向引物,即所述两条引物组合为权利要求1所述外源插入片段右边界侧翼序列特异性检测引物。
10.根据权利要求8所述外源插入片段右边界侧翼序列特异性检测引物,其特征在于,如SEQ-6和SEQ-7所示:
所述正向引物SEQ-6为:5’-TTCCACACAACATACGAGCCG-3’
所述反向引物SEQ-7为:5’-TGGGGAAAAATACATATTAGAACACTG-3’。
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