[发明专利]一种KASP结合口腔拭子无提取在QPCR平台进行人SNP基因分型的方法在审

专利信息
申请号: 201810064682.0 申请日: 2018-01-23
公开(公告)号: CN108179175A 公开(公告)日: 2018-06-19
发明(设计)人: 傅延;张鸿;张慧;徐子静 申请(专利权)人: 安徽微分基因科技有限公司
主分类号: C12Q1/6827 分类号: C12Q1/6827
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 238014 安徽省合肥市巢湖经济开发区龙泉路*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 拭子 口腔 样本 程序设置 基因分型 基因检测 实验成本 实验信息 数据分析 放入 分型 混匀 配制 改进
【权利要求书】:

1.一种KASP结合口腔拭子无提取在QPCR平台进行人SNP基因分型的方法,其特征在于:包括以下步骤:

步骤一,收集样本:

a:被检测人员用生理盐水漱口,半小时后用棉棒沿口腔外壁刮取口腔侧壁细胞,置于2mL保存管中;

b:对保存管使用600ul无核水重悬,制备重悬口腔细胞;

步骤二,配制KASP反应体系:反应体系的成分包括MasterMix、引物、样本,取总体积五分之一的重悬口腔细胞加入到反应体系中,然后混匀;

步骤三,将混匀后的溶液放入QPCR仪中,输入实验信息,选择genotyping目录下的程序设置:

a:选择94℃工作2-4min;

b:选择94℃工作10-30s;

c:选择65℃工作30-90s;

d:b-c步骤为降落PCR,每个循环降低0.8℃,共10个循环工作;

e:选择94℃工作10-30s;

f:选择57℃工作30-90s;

g:e-f步骤进行30个循环工作;

h:选择60℃工作1min后收集荧光;

步骤四:反应完成后下机进行数据分析并收集基因分型数据。

2.根据权利要求1所述的一种KASP结合口腔拭子无提取在QPCR平台进行人SNP基因分型的方法,其特征在于:步骤一中被检测人员刮取的口腔细胞样本干棒一周内进行检测则可以放置于4℃冰箱或常温保存,超过一周才能检测的样本需-20℃保存,以防止细胞中DNA降解。

3.根据权利要求1所述的一种KASP结合口腔拭子无提取在QPCR平台进行人SNP基因分型的方法,其特征在于:步骤三中QPCR仪工作过程中KASP反应程序同LGC官网。

4.根据权利要求1所述的一种KASP结合口腔拭子无提取在QPCR平台进行人SNP基因分型的方法,其特征在于:步骤四中下机数据会由仪器自动分型,部分样品由于拷贝数过低或质量问题,可能会导致无法分型。

5.根据权利要求1所述的一种KASP结合口腔拭子无提取在QPCR平台进行人SNP基因分型的方法,其特征在于:步骤四中首先将实验结果从仪器Download至电脑文件夹;再打开实验结果文件,一起能够将各个基因型自动分型,该方法也使用于其他平台的QPCR仪。

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