[发明专利]检测诺如病毒的方法

说明书

本公开文本提供了用于测定展现急性胃肠炎的患者是否将受益于用抑制诺如病毒基因群I(GI)或诺如病毒基因群II(GII)的治疗剂治疗的方法和组合物。本文所公开的方法是基于在进行实时反转录PCR之前不从临床样本提取病毒核酸的情况下检测粪便样品中的诺如病毒基因群I(GI)和诺如病毒基因群II(GII)。本公开文本还提供了用于实践该方法的试剂盒。

相关申请的交叉引用

本申请要求2016年6月3日申请的美国申请号62/345,331的权益和优先权，将该申请的内容通过引用以其全文结合在此。

技术领域

本公开文本提供了用于测定患有急性胃肠炎的患者是否将受益于抑制诺如病毒基因群I(GI)或诺如病毒基因群II(GII)的治疗剂治疗的方法和组合物。本技术的方法是基于在进行实时反转录PCR(RT-PCR)之前不从临床样本提取病毒核酸的情况下检测粪便样品中的诺如病毒基因群I(GI)和诺如病毒基因群II(GII)。本公开文本还提供了用于实践该方法的试剂盒。

发明背景

下文提供对本公开文本的背景的说明只为了帮助读者理解本公开文本，并且不承认该说明描述或构成本公开文本的现有技术。

诺如病毒是杯状病毒科(Caliciviridae)的无包膜单链RNA病毒，并且引起全世界所有人类胃肠炎暴发的60％至80％。人类诺如病毒每年在美国引起约两千一百万至两千三百万胃肠炎病例和800例死亡，并且在发展中国家引起超过218,000例死亡，主要是小于5岁的儿童。

人类诺如病毒具有约24小时的孵育期和约24-72小时的疾病长度。最常见症状是恶心、呕吐和腹泻，但是还可包括腹绞痛、发热、头痛和脱水。诺如病毒主要通过粪口途径传播，但也可通过雾化的呕吐物飞沫、被污染的食物或水和污染物传播。人类诺如病毒具有高传染性并且可在包括医疗机构、游船、饭店和学校的众多种环境中引起大爆发。

快速准确地检测诺如病毒感染对于在医疗和非医疗环境中防止病毒传播非常重要。诺如病毒分为六个基因群(GI-GVI)。GII基因型4(GII.4)诺如病毒每年引起所有人类诺如病毒胃肠炎的约60％-90％。GI和GII基因群在人类感染中最普遍，但人们认为，由于二者之间的巨大抗原差异而缺少共同的中和表位。显著的病毒多样性使得很难研发广谱保护性人类诺如病毒疫苗。

因此，业内非常需要可快速检测并区分临床粪便样品中的多种诺如病毒基因群(例如诺如病毒基因群I(GI)或诺如病毒基因群II(GII))的更稳健并且更灵敏的方法。

发明概述

本公开文本提供了用于检测和区分诸如粪便等复合生物样品中的多种诺如病毒基因群(例如诺如病毒基因群I(GI)或诺如病毒基因群II(GII))的组合物和方法。本技术的方法可对未经处理的粪便样品实施，得到直接的流线型的样品到结果的过程。在另一方面中，本技术的方法和组合物可用于选择用于患有急性胃肠炎的受试者的最佳治疗方案。预期本文所公开的方法允许快速、灵敏且同时地检测一个或多个对应于诺如病毒基因群I(GI)或诺如病毒基因群II(GII)的靶核酸序列。