[发明专利]碰撞截面碎片离子的化学类组合物

说明书

本公开整体涉及用于使用碰撞截面碎片离子值来确定样品中存在的化学类组合物的方法。

相关申请

本申请要求2016年6月30日提交的名称为“Chemical Class Compositions FromCollision Cross-Section Fragment Ions(碰撞截面碎片离子的化学类组合物)”的美国临时申请No.62/356636的优先权，该申请的整个内容以引用方式并入本文。

技术领域

本公开整体涉及使用碰撞截面碎片离子值来确定样品中存在的化学类组合物。

背景技术

复杂样品中化合物的结构阐明(例如，生物流体、来自植物和动物的组织、食物等)仍然是重要的分析挑战。例如，虽然代谢组学旨在全面剖析低分子量化合物，但当前估计值在典型生物样品中的10,000个代谢物范围内。另外，任何给定样品中的大多数代谢物在很大程度上是未知的。通常需要手动质谱数据解释。然而，对许多支架的预期碎片化图案的了解是有限的，因此进一步使分析复杂化。但是，仍然需要快速鉴定用于药物发现和开发、代谢组学、脂质组学和生物标志物发现的共同调节的化学类别。

发明内容

本公开提供了使用从碎片离子的碰撞截面(CCS)获得的信息来确定样品的化学类组合物的高通量且稳健的方法。

还提供了用于计算前体离子和产物离子的合成值以提高测量选择性的方法。

在一个方面，所提供的方法可用作其他分析方法的替代形式，或者与其他分析方法结合使用，以从复杂样品的多个碎片化谱中鉴定并分析大量化学类别。

附图说明

图1描绘了脑提取物的液相色谱法-离子迁移质谱法(MS)分析的色谱图。

图2示出了使用离子迁移MS仪器对人脑提取物的直接分析(输注)。

图3描绘了在使用本文所述的超高效液相色谱法分析的复杂脂质提取物的数据独立碎片化后获得的脂肪酰基基团的提取离子色谱图。

图4描绘了在本文所述的UHPLC-离子迁移MS分析之后，对于脂肪酰基EPA提取的野生型(WT)与转基因(TG)脂质的比较。

图5示出了从对照与辐射处理的小鼠的血浆样品中提取的特定碎片CCS值的分层聚类分析。

图6示出了来自对照与辐射处理的小鼠的血浆样品的非靶向CCS值的分层聚类分析。

图7示出了从健康对照与患有阿尔茨海默病的受试者的人脑样品中提取的前体/碎片CCS、RT值的相关分子网络分析。

图8描绘了碎片化在源内或在碰撞室中诱导之后脂质的镜像CCS指纹匹配。

具体实施方式

在一个实施方案中，提供了使用从碎片离子值的碰撞截面(CCS)获得的信息来确定样品的至少一种化学类组合物的方法，该方法包括：a)将样品碎片化以产生一系列产物离子和前体离子；使用离子迁移分离产物离子；b)获得产物离子的CCS值；以及c)将产物离子的CCS值与预定值匹配或关联。

在一个方面，在步骤a)和b)期间获得的用实验方法得到的离子特性(诸如母体离子的m/z比率、强度分布、洗脱位置和电荷以及前体离子的m/z比率、强度分布、洗脱位置、电荷和CCS)可与产物离子的CCS值结合使用以确定样品的至少一种化学类组合物。因此，在一个方面，本文的方法还包括获得选自前体离子的m/z比率、洗脱位置、强度分布、电荷和CCS值的至少一种离子特性；获得选自产物离子的m/z比率、洗脱位置、强度分布和电荷的至少一种离子特性；将前体离子的至少一种离子特性与母体离子的对应的至少一种离子特性关联；以及将前体离子和母体离子的至少一种离子特性与预定值匹配或关联，将产物离子的至少一种离子特性与预定值匹配或关联。