[发明专利]用于危重患者的死亡预后的生物标志物

说明书

公开了生物标志物和使用其辅助危重患者的诊断、预后和治疗的方法。具体来说，本发明涉及生物标志物用于患有脓毒症、严重创伤或烧伤的危重患者的死亡预后的用途。

交叉引用

本申请要求2016年6月26日提交的美国临时申请第62/354,789号的权益，所述申请通过引用的方式并入本文中。

关于联邦政府资助的研究或研发的声明

本发明是在美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)授予的合约AI057229、AI089859、AI109662和AI117925的政府支持下完成的。政府拥有发明的某些权利。

技术领域

本发明一般涉及危重患者死亡风险的预后的方法。具体来说，本发明涉及生物标志物的用途，所述生物标志物可用于患有脓毒症、严重创伤或烧伤的危重患者的死亡风险的预后。

背景技术

脓毒症，新定义由对感染的全身性反应引起的器官衰竭¹，在美国造成所有院内死亡的一半，并且也是美国医疗系统的之一总成本。^2，3尽管脓毒症的结果在过去十年中已经随着标准化脓毒症护理的改善而改善，但死亡率仍然很高(10-35％)⁴。脓毒症治疗仍由来源控制、抗生素和支持性护理组成。尽管对于免疫调节干预有许多临床试验，但没有成功地将对脓毒症有特异性的治疗引入市场⁵。两个共识的文件已经指出，临床试验的失败是由于脓毒症综合征患者的巨大异质性，并且我们缺乏精确分子分析的工具^5，6。目前的工具，主要是临床严重程度评分，例如APACHE和SOFA，以及血乳酸含量，不是脓毒症中潜在炎症的读数，而是对患者疾病的整体程度的粗略观察。

几个小组已经假设，通过全血分析的免疫系统的转录(全基因组表达)分布可以是使脓毒症患者分层的有效方式⁷。从这些研究中重要的见解包括中性粒细胞蛋白酶的过表达、在适应性免疫中崩溃和脓毒症总体深入的免疫失调^7-12。一些免疫分析技术已前瞻性地证实展示结果差异^13，14，但是还没有临床工具被翻译成临床实践。尽管如此，大多数这些研究已经存放在公共数据库中，以便进一步重新分析和重复使用。

因此，需要新的分子分布分析工具，既可以改善患者护理和资源分层，但也可以作为脓毒症更好的临床试验的研究工具。

发明内容

本发明涉及生物标志物用于辅助危重患者的诊断、预后和治疗的用途。具体来说，本发明涉及生物标志物用于患有脓毒症、严重创伤或烧伤的危重患者的死亡预后的用途。

可以在本发明的实践中使用的生物标志物包括多核苷酸，其包含来自基因或基因的RNA转录物的核苷酸序列，包括但不限于DEFA4、CD163、PER1、RGS1、HIF1A、SEPP1、C11orf74、CIT、LY86、TST、OR52R1和KCNJ2。

在某些实施例中，将一组生物标志物用于死亡的预后。任何尺寸的生物标志物组可用于本发明的实践中。用于死亡预后的生物标志物组通常包含至少3种生物标志物和至多30种生物标志物，包括其间的任何数量的生物标志物，例如3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30种生物标志物。在某些实施例中，本发明包括生物标志物组，其包含至少3种、至少4种、或至少5种、或至少6种、或至少7种、或至少8种、或至少9种、或至少10种、或至少11种或更多种生物标志物。尽管较小的生物标志物组通常更经济，但较大的生物标志物组(即，大于30种生物标志物)具有提供更详细信息的优点，并且还可以用于本发明的实践中。