[发明专利]包含重组T细胞受体的组合物和文库以及使用重组T细胞受体的方法

说明书

提供了重组多核苷酸，包括编码具有来自作为本发明实施方式的新的AL、KQ、PP、19305CD8、BB、KB、ST、JD、19305DP、PB‑P、PB‑T和PB13.2T细胞受体(TCR)中任一种的氨基酸序列的TCR的α链和/或β链的表达载体。提供了包含多核苷酸的细胞，以及重组多核苷酸和表达载体的文库。提供了方法，该方法包括向个体给予表达新的重组TCR的经过修饰的人类T细胞。该方法用于预防和/或治疗被诊断患有癌症、怀疑患有癌症或具有癌症发展或复发风险的个体，其中所述癌症包括表达NY‑ESO‑1和/或其高度同源的LAGE‑1抗原的癌细胞。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2016年1月6日提交的美国临时专利申请第62/275,600号的优先权，通过引用将其公开结合于此。

技术领域

本公开大体上涉及免疫疗法，更具体地涉及可以赋予T细胞直接肿瘤识别能力的重组T细胞受体。

背景技术

肿瘤抗原特异性T细胞通过采用特异性针对肿瘤抗原肽/HLA复合物的独特T细胞受体(TCR)α和β链复合物来识别并杀死癌细胞。极其多样化的TCRα/β序列单独地决定了肽特异性、HLA限制和识别强度。对具有肿瘤抗原特异性TCR的多克隆扩增的外周T细胞进行基因工程产生大量肿瘤抗原特异性T细胞，其可通过采用自体基因工程化的T细胞而用于癌症患者的过继性T细胞疗法。目前，在临床试验中仅测试了少数治疗性TCR基因产物，这明显限制了该强有力的治疗策略对于被其HLA类型及癌细胞中的抗原表达受限的患者的适用性。因此，对用于在涉及重组TCR的过继免疫疗法中使用的改进组合物和方法还存在持续的未被满足的需求。而本公开满足了这种需求。

发明内容

在一个方面，本公开提供了经过修饰的人类T细胞，其包含编码TCR的α链和/或β链的重组多核苷酸，其中TCR是本文所称为如下文进一步描述的AL、KQ、PP、19305CD8、BB、KB、ST、JD、19305DP、PB-P、PB-T或PB13.2的TCR之一。在另一个方面，本公开包括用于预防和/或治疗被诊断患有癌症、怀疑患有癌症或具有癌症发展或复发风险的个体的方法，其中所述癌症包括表达NY-ESO-1和/或其高度同源的LAGE-1抗原的癌细胞，该方法包括向所述个体给予表达本公开的重组TCR的经过修饰的人类T细胞。

在另一个方面，本公开包括编码TCR的表达载体，其中TCR包含具有如下文进一步描述的19305DP AL、KQ、PP、19305CD8、BB、KB、ST、JD、PB-P、PB-T或PB13.2的序列的α链和/或β链。

在另一个方面，本公开提供了包含多种表达载体的文库，其中所述表达载体编码选自如下文进一步描述的TCR(19305DP、AL、KQ、PP、19305CD8、BB、KB、ST、JD、PB-P、PB-T或PB13.2)的本文所描述的TCRα链和β链的组的至少一种α链和/或β链或其组合。在一个实施例中，文库可以进一步包含至少一种编码也在下文中进一步描述的TCR(JM、5B8、SB95)的α链、β链或其组合的表达载体。

在另一个方面，本公开提供了用于在将表达载体引入至被诊断个体的免疫细胞中使用的方法，该方法包括：从本公开的文库中选择表达载体，其中所述选择至少部分基于被诊断患有或怀疑患有NY-ESO-1/LAGE-1阳性癌症的个体的HLA类型，以及将所选择的表达载体分配给一方。

在另一个方面，本公开提供了一种方法，包括从本公开的表达载体文库中选择表达载体，并将表达载体引入至从诊断为患有NY-ESO-1/LAGE-1阳性癌症的个体获得的免疫细胞中，其中由表达载体编码的TCR的HLA类型与个体的HLA类型匹配，该方法可选地包括将包含表达载体的免疫细胞导入需要其的个体中。