[发明专利]一种陆地棉早熟分子育种相关SSR标记位点的鉴定方法

说明书

本发明公开了一种陆地棉早熟分子育种相关SSR标记位点的鉴定方法。以中晚熟棉花品种鲁棉研37号为母本，以早熟棉花品种鲁棉研19号为父本，杂交1代，再自交1代获得F2，在F2群体中选择1/8的早熟株系和1/8的晚熟株系，种植F3，自交获得F4，利用F2群体进行早熟相关SSR标记位点的第一次鉴定，最后进行卡方分析，初步确定受苗蕾期性状选择有效的陆地棉早熟分子育种相关SSR标记。利用F4群体进行早熟相关SSR标记位点的第二次鉴定，最后进行卡方分析，最终确定受苗蕾期性状选择有效的陆地棉早熟分子育种相关SSR标记。本发明的有益效果是为陆地棉早熟分子育种提供了可靠的分子标记位点支持。

技术领域

本发明属于作物育种技术领域，涉及一种陆地棉早熟分子育种相关SSR标记位点的鉴定方法。

背景技术

棉花早熟性是一个优良的综合性状，主要包括全生育期、苗期、蕾期、花铃期、第一果枝位和霜前花率等性状，但这些性状都是数量性状，受多个数量性状基因位点的控制，遗传机理复杂且易受环境因素影响；传统育种方法主要依赖育种家的经验，对早熟性相关性状很难准确把握，因此传统育种方法缺乏预见性，效率低。

棉花早熟性是数量性状，传统的遗传学分析方法很难准确跟踪定位目标基因在杂交后代中的流向，分子标记技术的发展为数量性状的研究提供了有效工具。连锁分析与关联分析是目前研究植物数量性状基因型的主要方法，利用连锁分析已经定位了生育期、苗期、蕾期、花铃期、第一果枝位、第一果枝位高度和霜前花率等与陆地棉早熟性状相关的QTL(Li C,Wang X,Na D,et al.QTL analysis for early-maturing traits in cottonusing two upland cotton(Gossypiumhirsutum L.)crosses[J].Breeding Science,2013,63(2):154-163.)，但QTL作图亲本不是生产上推广面积较大的生产品种，而且QTL作图分析无法检测到构建作图群体亲本中都存在但没有差异的等位基因，而且定位到的QTL具有较强的“群体专一性”，因此基于连锁分析的QTL作图分析研究成果难以直接应用于棉花品种早熟性状的遗传改良。利用连锁分析已得到了与陆地棉早熟相关性状显著关联的3个SSR位点，其中CER0098-400与全生育期显著关联，DPL0375-250和HAU2414-147与果枝始节位显著关联(梁冰等，陆地棉农艺性状与SSR(Simple Sequence Repeats)标记的关联分析，棉花学报，26(5)：387-395)，但是，多年来并未发现利用获得的棉花早熟性相关性状显著关联的分子标记位点指导棉花早熟育种的详细报道，这是因为利用关联分析获得的陆地棉早熟性相关分子标记位点未验证其是否与棉花早熟性目标性状紧密连锁，而且这些分子标记关联的目标性状在早熟育种方面不利于指导辅助选择。

“遗传搭车”(genetic hitch-hiking)效应是指当群体中发生对选择相关的等位基因替代时，由于选择压力的作用，与选择目标有利的基因及其连锁位点的等位基因频率上升，而不利的基因及其连锁位点的等位基因频率下降，理论上那些与目标性状无关的基因位点不会受定向选择的影响，在分离群体中仍符合孟德尔分离规律。基于该原理，可利用陆地棉早熟育种选择群体逆向鉴定陆地棉早熟相关性状的紧密连锁分子标记位点，真正实现分子标记辅助选择在陆地棉早熟育种实践中的应用。

发明内容

本发明的目的在于提供一种陆地棉早熟分子育种相关SSR标记位点的鉴定方法。

本发明的目的可通过如下技术方案实现：

1)以中晚熟棉花品种鲁棉研37号为母本，以早熟棉花品种鲁棉研19号为父本，杂交1代，再自交1代获得F2，F2代按单株收获；依据苗蕾期性状，在F2群体中选择约1/8的早熟株系和约1/8的晚熟株系，种植F3，自交获得F4，每代都是混收混种；