[发明专利]一种利用表面阳离子化的R-藻红蛋白检测DNA杂交的方法有效
申请号: | 201711261916.2 | 申请日: | 2017-12-04 |
公开(公告)号: | CN108037103B | 公开(公告)日: | 2020-04-28 |
发明(设计)人: | 吴继魁;陆云飞;任宁娜;张俊玲 | 申请(专利权)人: | 上海海洋大学 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64;G01N33/53;C12Q1/6816 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 201306 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 表面 阳离子 蛋白 检测 dna 杂交 方法 | ||
1.一种利用表面阳离子化的R-藻红蛋白检测DNA杂交的方法,其特征在于:
(1)将R-藻红蛋白在4℃下离心超滤脱盐;
(2)将R-藻红蛋白与阳离子聚合物PDADMAC以摩尔浓度1:50的比例混合均匀;
(3)用爱丁堡一体化稳态瞬态荧光光谱仪FS5分别检测阳离子化前后的R-藻红蛋白荧光强度;
(4)将(2)的混合溶液与猝灭基团BHQ2修饰的DNA单链溶液以摩尔浓度1:5的比例混合均匀并稀释至100μL,静置2分钟后测量其荧光强度,观察到荧光猝灭88%左右;
(5)将猝灭基团BHQ2修饰的DNA单链溶液与未修饰的完全互补链溶液以摩尔浓度1:1的比例混合均匀,然后将(2)的溶液与其以摩尔浓度1:5的比例混合均匀并稀释至100μL,静置2分钟后测量其荧光强度,观察到荧光强度基本没有发生变化;
(6)将猝灭基团BHQ2修饰的DNA单链溶液与未修饰的完全互补链溶液分别以摩尔浓度5:1,5:2,5:3,5:4,1:1的比例混合均匀,然后将(2)的溶液与其以摩尔浓度1:5的比例混合均匀并稀释至100μL,静置2分钟后测量其荧光强度,观察到荧光强度逐渐释放,最终与R-藻红蛋白的荧光强度基本相同;
(7)将猝灭基团BHQ2修饰的DNA单链溶液与未修饰的单碱基错配互补链溶液以摩尔浓度1:1的比例混合均匀,然后将(2)的溶液与其以摩尔浓度1:5的比例混合均匀并稀释至100μL,静置2分钟后测量其荧光强度,观察到荧光强度猝灭20%左右。
2.按权利要求1所述的一种利用表面阳离子化的R-藻红蛋白检测DNA杂交的方法,其特征在于:所述步骤(1)~(7)中稀释所用的缓冲液为50mMPBS缓冲液,pH=7.5。
3.按权利要求1所述的一种利用表面阳离子化的R-藻红蛋白检测DNA杂交的方法,其特征在于:所述步骤(1)中离心条件优选为3800rcf,离心25~30min。
4.按权利要求1所述的一种利用表面阳离子化的R-藻红蛋白检测DNA杂交的方法,其特征在于:所述步骤(1)中所述的超滤次数优选为4~5次,超滤管大小为100kD。
5.按权利要求1所述的一种利用表面阳离子化的R-藻红蛋白检测DNA杂交的方法,其特征在于:所述步骤(3)~(7)中所述的荧光强度的检测,激发波长为535nm,发射波长为575nm。
6.按权利要求1所述的一种利用表面阳离子化的R-藻红蛋白检测DNA杂交的方法,其特征在于:所述步骤(4)~(7)中所述的BHQ2修饰的DNA单链可以为任意序列的通链。
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