[发明专利]一种合成桧烯的基因工程菌及其构建方法与应用有效
申请号: | 201711130703.6 | 申请日: | 2017-11-15 |
公开(公告)号: | CN109777745B | 公开(公告)日: | 2020-04-24 |
发明(设计)人: | 咸漠;刘丽娟;张海波;黄世永 | 申请(专利权)人: | 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 |
主分类号: | C12N1/19 | 分类号: | C12N1/19;C12N15/81;C12P5/00;C12R1/865 |
代理公司: | 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211 | 代理人: | 邓宇 |
地址: | 266101 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 合成 基因工程 及其 构建 方法 应用 | ||
1.一种合成桧烯的基因工程菌,其特征在于,该基因工程菌的出发菌株为酵母菌,所述酵母菌敲除了GAL80基因,含有经过密码子优化的桧烯合成酶基因SabS1,GenBank登录号为DQ785794.1,其序列如SEQ1所示,所述桧烯合成酶基因SabS1整合在该酵母菌株染色体GAL80位点;所述酵母为酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)CEN.PK2-1C,基因型为MATa;ura3-52;trp1-289;leu2-3_112;his3Δ1;MAL2-8c;SUC2。
2.根据权利要求1所述的一种合成桧烯的基因工程菌,其特征在于,所述酵母菌还含有如下序列:
桧烯合成酶基因SabS1的启动子-GAL1启动子,记为PGAL1,其序列如SEQ2所示;
桧烯合成酶基因SabS1的终止子-CYC1终止子,记为TCYC1,其序列如SEQ3所示;
GAL80基因的起始密码子上游的511bp,记为GAL80US,其序列如SEQ4所示;
GAL80基因的终止密码子下游的501bp,记为GAL80DS,其序列如SEQ5所示。
3.权利要求2所述的一种合成桧烯的基因工程菌的构建方法,其特征在于,该构建方法包括如下步骤:
(1)将GAL80基因的起始密码子上游的511bp,与终止密码子下游501bp以及PGAL1-SabS1-TCYC1片段连接,构建供体DNA片段:GAL80US-PGAL1-SabS1-TCYC1-GAL80DS;
(2)将pML04质粒用限制性内切酶SwaⅠ和BclⅠ进行双酶切,获得线性化的pML104质粒;
(3)以序列TAAGGCTGCTGCTGAACGT为靶标序列,构建gRNA的表达片段;
(4)将步骤(1)-步骤(3)所述的供体DNA片段、线性化的pML104质粒和gRNA表达片段同时转入酿酒酵母CEN.PK2-1C感受态细胞,得到酵母基因工程菌。
4.根据权利要求3所述的一种合成桧烯的基因工程菌的构建方法,其特征在于,该菌株构建方法包括如下步骤:
(1)先将经过密码子优化的桧烯合成酶基因SabS1连接到商品质粒pESC-HIS,得到重组质粒pESC-HIS-SabS1,通过PCR获得PGAL1-SabS1-TCYC1片段;然后将GAL80基因的起始密码子上游511bp、PGAL1-SabS1-TCYC1片段、终止密码子下游501bp依次连接到商品质粒pUC19,得到重组质粒pUC19-GAL80US-PGAL1-SabS1-TCYC1-GAL80DS,最后通过PCR获得供体DNA片段:GAL80US-PGAL1-SabS1-TCYC1-GAL80DS;
(2)将pML04质粒先用限制性内切酶SwaI酶切7h,再加入限制性内切酶BclI酶切4h,将酶切产物通过凝胶回收,获得线性化的pML104质粒;
(3)以靶标序列TAAGGCTGCTGCTGAACGT为中心,分别构建与质粒pML104同源的gRNA表达片段的上下游两个片段,再通过重叠PCR将两个片段融合到一起获得完整的gRNA表达片段;
(4)将步骤(1)-步骤(3)所述的供体DNA片段、线性化的pML104质粒和gRNA表达片段同时转入酿酒酵母CEN.PK2-1C感受态细胞,培养后获得酵母基因工程菌,其中用量为:供体DNA片段400-1000ng、线性化的pML104质粒100-150ng、gRNA表达片段200-600ng。
5.权利要求1或2所述合成桧烯的基因工程菌在合成桧烯中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,将权利要求1或2所述的基因工程菌经一级种子培养基培养后,获得的二级种子接种到二级种子培养基中进行发酵得到桧烯。
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