[发明专利]Docker技术在高通量测序数据分析中的应用

权利要求书

1.Docker技术在高通量测序数据分析中的应用。

2.一种Docker技术用于高通量测序数据分析的方法，其特征在于：包括如下步骤：

(1)Docker生物云平台基础镜像的搭建：

Ⅰ.使用docker commit命令构建基础镜像，再由docker run进入镜像的交互模式；

Ⅱ.在交互式模式下，下载、安装高通量测序数据分析所需要的软件及依赖的语言并保存镜像；

(2)生物高通量测序数据分析流程的搭建及生物云计算平台镜像的构建：

根据生物高通量测序数据分析流程及所使用的软件，在已安装软件及语言的基础镜像中搭建生物信息分析流程，再通过docker commit提交生成生物云计算平台镜像；

(3)生物云计算平台镜像的迁移与使用：

Ⅰ.通过docker save命令将配置完成的生物云计算平台镜像保存为一个tar压缩包；

Ⅱ.将tar压缩包上传到需要进行生物高通量测序数据分析的服务器目录，再通过docker load命令导入生物云计算平台镜像；

Ⅲ.通过docker run命令挂载需要分析的数据信息及数据注释文件到导入成功的生物云计算平台镜像中；

Ⅳ.在生物云计算平台镜像中调用已经配置好的分析流程运行即可对数据进行分析。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于：所述的高通量测序数据分析为ChIP-Seq数据分析时，所需要的软件及依赖的语言包括：FastQC、Trimmomatic、BWA、MACS2、samtools、bedtools、MEME、Python、Perl。