[发明专利]膀胱癌组织T细胞图谱模型及其构建方法和构建系统

说明书

一种膀胱癌组织T细胞图谱模型及其构建方法和构建系统，其中构建方法包括如下步骤：设置疾病组与对照组，其中，疾病组取膀胱癌患者膀胱癌组织的标本待用，对照组取膀胱癌患者膀胱癌旁组织的标本待用；提取各标本的全基因组DNA；扩增出TCR的CDR3区，分别得到疾病组文库和对照组文库；采用高通量测序技术，对所述疾病组文库和所述对照组文库进行测序；对测序结果进行分析，构建膀胱癌组织T细胞图谱模型。上述膀胱癌组织T细胞图谱模型的构建方法，通过膀胱癌组织和癌旁组织免疫组库测序分析TCR数量的变化，能发现那些高克隆扩增TCR CDR3序列，可间接获知这些高克隆扩增T细胞亚家族的分布特点，从而有利于进一步研究膀胱癌发生发展机制。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，特别是涉及一种膀胱癌组织T细胞图谱模型的及其构建方法及和构建系统。

背景技术

膀胱癌(Bladder cancer)是指膀胱内细胞恶性过度生长。转移性膀胱癌患者及晚期膀胱癌患者的中位存活时间仅约14个月，而能获得无肿瘤进展生存的患者仅占15％。这不仅严重危害着人类健康，而且给家庭、社会、国家带来严重的经济负担，已经成为一个需要迫切解决的社会公共卫生问题。

近年来，肿瘤微环境中各种细胞间复杂的相互作用逐渐被人们认识，其中T淋巴细胞在其中发挥着重要作用。T淋巴细胞(T-lymphocytes)是来源于骨髓的多能干细胞，具有多种生物学功能，如直接杀伤靶细胞、抑制B淋巴细胞产生抗体，对特异性抗原产生应答反应和产生细胞因子等。T淋巴细胞对于膀胱癌细胞具有一定的杀死作用，作为细胞免疫的主力军，其对膀胱癌的治疗和抑制具有非常重要的作用。然而，在膀胱癌患者中，肿瘤微环境内的T淋巴细胞通常处于被抑制或者不识别状态。其中，T细胞抗原受体(T cell receptor，TCR)为存在于T淋巴细胞膜表面能够识别蛋白质抗原的受体，为所有T细胞的特有标志，是T细胞识别不同的抗原及被激活的中心环节。

因此，需要更深层次的了解与肿瘤抗原结合的T细胞受体的基因序列信息和多样性变化，因为这能更深层次的揭开T淋巴细胞参与肿瘤免疫的机理，客观准确地评估膀胱癌免疫状态，为进一步阐明膀胱癌的病因学及发病机制提供理论基础。

发明内容

基于此，有必要提供一种膀胱癌组织T细胞图谱模型及其构建方法和构建系统。

一种膀胱癌组织T细胞图谱模型的构建方法，包括如下步骤：设置疾病组与对照组，其中，疾病组取离体的膀胱癌患者膀胱癌组织的标本待用，对照组取离体的膀胱癌患者膀胱癌旁组织的标本待用；提取各标本的全基因组DNA；扩增出TCR的CDR3区，分别得到疾病组文库和对照组文库；采用高通量测序技术，对所述疾病组文库和所述对照组文库进行测序；对测序结果进行分析，构建膀胱癌组织T细胞图谱模型。

一种膀胱癌组织T细胞图谱模型，由如上任一实施例中所述的构建方法制备得到。

一种膀胱癌组织T细胞图谱模型的构建系统，采用如上任一实施例中所述的构建方法实现。

上述膀胱癌组织T细胞图谱模型的构建方法，通过膀胱癌组织和癌旁组织免疫组库测序分析TCR数量的变化，能发现那些高克隆扩增TCR CDR3序列，可间接获知这些高克隆扩增T细胞亚家族的分布特点，从而有利于进一步研究膀胱癌发生发展机制。对这些信息进一步进行验证分析和研究将有助于揭开T淋巴细胞参与肿瘤免疫的机理，客观准确地评估膀胱癌免疫状态，进一步阐明膀胱癌的病因学及发病机制。

附图说明

图1为本发明一实施方式的膀胱癌组织T细胞图谱模型的构建方法的步骤流程图；

图2为本发明另一实施方式的膀胱癌组织T细胞图谱模型的构建方法的步骤流程图；

图3为本发明又一实施方式的膀胱癌组织T细胞图谱模型的构建方法中的CDR3氨基酸序列长度分布图。

具体实施方式