[发明专利]一种评估乳腺癌风险的突变基因及其检测试剂盒

说明书

本发明公开了一种评估乳腺癌风险的突变基因。本发明还公开了一种乳腺癌突变基因检测的特异性引物及其检测试剂盒。本发明利用ARHGEF18、RPTN和TTC21B基因的突变位点开发评估乳腺癌风险的检测试剂盒，该试剂盒具有敏感性强，准确率高等优点，且方法简单、快速，对乳腺癌的早期筛查、预后评估具有重要的意义，也为基因治疗、药物治疗等临床应用提供了重要依据。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，具体涉及一种评估乳腺癌风险的突变基因及其检测试剂盒。

背景技术

乳腺癌是一种全身性疾病、其发生和发展是一个涉及多因素、多环节的复杂过程，包括癌基因的激活以及抑癌基因的失活等。因此，基因突变在乳腺癌的发生、发展过程中起着非常重要的作用。

乳腺癌是一个多因素遗传变异性疾病，只有不足10％是由于单基因缺陷引起的。随着高通量基因技术的发展，越来越多与乳腺癌相关基因被发现，这些基因上潜在的遗传变异(单核苷酸多态和拷贝数变异)可能引起乳腺癌药物治疗效果的差异。由于遗传变异的存在使抗肿瘤药物的代谢途径以及药物作用的目标基因可能受到影响，进而影响疗效以及预后。

遗传性乳腺癌最常见的标志物为BRCA1和BRCA2基因的突变，但BRCA1/2基因突变检测乳腺癌以及治疗癌症通常是不够的，因为这些基因突变不发生在大量的偶发的癌症，只能用来解释一小部分遗传性乳腺癌的病因。

突变位点的存在被认为赋予个体不同表型性状，以及对环境暴露、药物治疗等的不同反应，因此突变位点可能是导致个体疾发生发展差异的重要遗传基础。将疾病易感的突变谱用于疾病的辅助诊断，具有广泛的应用前景。若能筛选出存在于偶发的癌症中的基因突变位点来诊断和预后乳腺癌，将对乳腺癌个体化治疗产生重要指导意义，并为其药物筛选及药效评价开辟新的途径。

发明内容

本发明的目的是针对上述技术问题，提供一种评估乳腺癌风险的突变基因及其检测试剂盒。

本发明的目的是通过下列技术方案实现的：

本发明首先提供了一种检测乳腺癌风险的突变基因，其特征在于，所述的突变基因选自以下ARHGEF18、RPTN和/或TTC21B中的一个或几个基因，所述突变基因的突变位点如下：

(1)ARHGEF18:NM_001130955:exon12:c.C2101T:p.Q701X；

(2)RPTN:NM_001122965:exon3:c.C1834T:p.Q612X；

(3)TTC21B:NM_024753:exon1:c.20_21insGGTGAGCGGGTGAGCG:

p.K7_T8delinsKVSGX。

其中，X代表终止密码子。

ARHGEF18基因编码的蛋白质是鸟嘌呤核苷酸交换因子，属于RhoGTPase GFE家族。家族成员具有共同的特征，Dbl(DH)同源结构域，其是pleckstrin(PH)同源结构域。Rho GTP酶是调节细胞功能的GTP结合蛋白。Rho GTP酶在调节细胞骨架形成，基因转录，细胞周期及膜泡运输中起着重要作用，与肿瘤及神经性疾病发生也有密切关系，在体内扮演着分子开关的角色。Rho GTP酶的活化受到鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEFs)的直接控制。

RPTN基因位于1q21染色体上，人RPTN属于S100蛋白家族新成员，N端有两个能与Ca²⁺可逆结合的EF手型结构域和内部含有富含谷氨酰胺残基的串联重复序列，是一种与角质细胞被膜形成有关的前体蛋白。RPTN在人的中枢神经系统广泛表达，尤其在海马、前额叶和蓝斑核等区域高表达，这些高表达的区域与精神分裂症、抑郁症的关系密切。