[发明专利]一种鉴别9种黄檀属木材的DNA组合条形码及其鉴别方法和应用有效
申请号: | 201710500410.6 | 申请日: | 2017-06-27 |
公开(公告)号: | CN107287300B | 公开(公告)日: | 2018-07-06 |
发明(设计)人: | 殷亚方;余敏;焦立超;何拓;郭娟;张永刚;姜笑梅 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院木材工业研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京和信华成知识产权代理事务所(普通合伙) 11390 | 代理人: | 胡剑辉 |
地址: | 100091 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴别 条形码 木材 国际贸易公约 条形码序列 野生动植物 传统木材 高效可靠 技术支持 木材经营 执法部门 质量检验 应用 贸易 检疫 海关 | ||
1.一种鉴别9种黄檀属木材的DNA组合条形码,其特征在于,所述DNA组合条形码是ITS2+trnH-psbA组合条形码;
所述ITS2+trnH-psbA序列如SEQ ID No.9-17所示;
所述9种黄檀属木材分别为降香黄檀Dalbergia odorifera T.C.Chen、黄檀D.hupeanaHance、海南黄檀D.hainanensis Merr.&Chun、交趾黄檀D.cochinchinensis Pierre、阔叶黄檀D.latifolia Roxb.、东非黑黄檀D.melanoxylon Guill.&Perr.、奥氏黄檀D.oliveriPrain、微凹黄檀D.retusa Hemsl.和伯利兹黄檀D.stevensonii Standl.。
2.一种鉴别9种黄檀属木材的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
(1)将木材样品研磨处理成木粉;
(2)提取步骤(1)所得的木粉样品的DNA;
(3)以步骤(2)提取得到的DNA为模板,PCR扩增所述ITS2和trnH-psbA条形码序列;
(4)将步骤(3)得到的PCR扩增产物进行测序,得到ITS2和trnH-psbA序列,并对其进行组合;
(5)以步骤(4)所得的ITS2+trnH-psbA条形码组合与权利要求1中所述9种黄檀属木材的ITS2+trnH-psbA序列进行聚类分析,构建系统发育进化树,鉴别树种。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,扩增ITS2序列的正反引物如SEQ ID No.1-2所示,扩增trnH-psbA序列的正反引物如SEQ ID No.3-4所示 。
4.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中PCR扩增反应体系为0.5-3UDNA聚合酶、1.0-2.0mM MgCl2、200μM单一dNTP、0.1-5.0μM单一引物、pH7.0-8.0的0.1-1.5mg/mL牛血清白蛋白和10-1000ng模板DNA;
所述步骤(3)中PCR反应条件为94-96℃预变性0.5-10min;94-96℃变性0.05-2min,40-65℃退火0.5-2min,72℃延伸0.3-2min,循环20-50次;72℃终延伸2-15min。
5.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(5)中构建系统发育进化树采用的方法为邻接法。
6.权利要求1所述DNA组合条形码,或权利要求2所述鉴别9种黄檀属木材的方法在黄檀属木材鉴别中的应用。
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