[发明专利]TTC21B基因突变体及其应用有效
申请号: | 201710436649.1 | 申请日: | 2017-06-12 |
公开(公告)号: | CN109022444B | 公开(公告)日: | 2022-01-28 |
发明(设计)人: | 魏晓明;毛良伟;杨昀;满建芬;李龙;郭学芹;杜丽缺 | 申请(专利权)人: | 湖北华大基因研究院;武汉华大医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C07K14/47;C12M1/34;C12N5/10;C12N15/85;A01K67/027 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵天月 |
地址: | 430000 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | ttc21b 基因 突变体 及其 应用 | ||
本发明公开了TTC21B基因突变体及其应用,具体涉及分离的编码TTC21B突变体的核酸,分离的多肽,筛选易患肾单位肾痨12型的生物样品的系统,用于筛选易患肾单位肾痨12型的生物样品的试剂盒,以及构建药物筛选模型的方法。其中,该分离的编码TTC21B突变体的核酸,与SEQ ID NO:1相比,同时具有c.1552TC突变和c.895TC突变。通过检测该新突变体在生物样品中是否存在,可以有效地检测生物样品是否易患肾单位肾痨12型。
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体地,涉及TTC21B基因突变体及其应用,更具体地,涉及分离的编码TTC21B突变体的核酸、分离的多肽、筛选易患肾单位肾痨12型的生物样品的系统、用于筛选易患肾单位肾痨12型的生物样品的试剂盒、构建体、重组细胞以及构建药物筛选模型的方法。
背景技术
肾单位肾痨12型(Nephronophthisis 12,NPHP12)是一种可导致终末期肾病的常染色体隐性遗传病,本病是一种进行性肾小管间质性肾病,主要组织学特征为进行性肾小管间质肾病、肾小管基底膜增厚、间质纤维化、晚期髓样囊肿。有些患者呈现肾外症状包括视网膜、骨骼和中枢神经系统缺陷。
肾单位肾痨12型人群发病率约为1/50000。虽然目前已发现一些肾单位肾痨12型的致病基因,但仍存在着相当一部分未知致病基因位点。
因而,目前对肾单位肾痨12型的研究仍有待深入。
发明内容
本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此,本发明的一个目的在于提出一种有效筛选肾单位肾痨12型的生物样品的手段。
需要说明的是,本发明是基于发明人的下列工作而完成的:
发明人通过高通量外显子组测序联合候选基因突变验证的方法确定了遗传性肾单位肾痨12型疾病新的致病基因突变位点,TTC21B(NM_024753.4)基因编码区检出两个错义变异:c.1552TC(导致第518位半胱氨酸变为精氨酸,即p.C518R)和c.895TC(导致第299位半胱氨酸变为精氨酸,即p.C299R),均为杂合子。并且,发明人进一步验证了这两个错义变异同时存在能够导致肾单位肾痨12型疾病。
因而,根据本发明的第一方面,本发明提供了一种分离的编码TTC21B突变体的核酸。根据本发明的实施例,与SEQ ID NO:1相比,所述核酸同时具有c.1552TC突变和c.895TC突变。在本发明中,采用本领域通用表示法表示突变。c.1552TC表示cDNA第1552位核苷酸由T变成C;c.895TC表示cDNA第895位核苷酸由T变成C。发明人惊奇的发现,该突变体与肾单位肾痨12型的发病密切相关,从而通过检测该突变体在生物样品中是否存在,可以有效地检测生物样品是否易患肾单位肾痨12型,根据本发明的实施例,该突变体的核酸进一步丰富了TTC21B基因的致病突变图谱,更深入阐明了肾单位肾痨12型的分子发病机制,为肾单位肾痨12型的早期致病基因筛查和干预治疗提供科学依据。
根据本发明的第二方面,本发明还提供了一种分离的多肽。根据本发明的实施例,与SEQ ID NO:3相比,所述分离的多肽同时具有p.C518R突变和p.C299R突变。在本发明中,采用本领域通用表示法表示突变。p.C518R表示蛋白质水平第518位密码子由半胱氨酸变为精氨酸;p.C299R表示蛋白质水平第299位密码子由半胱氨酸变为精氨酸。具体地,致病基因TTC21B上的c.1552TC突变引起蛋白质水平的p.C518R突变,同时c.895TC突变,导致p.C299R突变。通过检测生物样品中是否表达该多肽,可以有效地检测生物样品是否易患肾单位肾痨12型。
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