[发明专利]适用于荷花淹水胁迫基因表达研究的内参基因及其应用有效
申请号: | 201710348433.X | 申请日: | 2017-05-17 |
公开(公告)号: | CN107245515B | 公开(公告)日: | 2021-07-09 |
发明(设计)人: | 徐君;姜红卫;李欣;江君;蒋华伟 | 申请(专利权)人: | 苏州市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 苏州睿昊知识产权代理事务所(普通合伙) 32277 | 代理人: | 伍见 |
地址: | 215155 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 适用于 荷花 淹水 胁迫 基因 表达 研究 内参 及其 应用 | ||
本发明公开了适用于荷花淹水胁迫基因表达研究的内参基因,内参基因包括:荷花肌动蛋白actin基因和核糖体蛋白18sRNA基因。本发明公开了2个用于研究荷花淹水胁迫基因表达的内参基因,并揭露了利用这2个基因为基础设计的实时荧光定量PCR引物,解决了荷花淹水胁迫基因表达研究中没有内参基因的现状,本发明的内参基因可在荷花应对淹水胁迫时稳定表达,所设计的实时荧光定量PCR引物用于荷花应对淹水胁迫时的基因表达分析,可提高研究的稳定性、可靠性和重复性。
技术领域
本发明涉及农业生物技术领域,具体涉及荷花淹水胁迫基因表达领域,尤其是适用于荷花淹水胁迫基因表达研究的内参基因及其应用。
背景技术
荷花是多年生挺水植物,是我国十大名花中唯一的水生花卉,因花色丰富、群体花期长、叶色碧绿、深受人们的喜爱,加上寓意深刻、文化价值,是极好的水景园林美化植物和家庭园艺常用植物,在我国应用和分布都极其广泛。淹水胁迫:荷花是一种水生花卉,环境的变化使荷花时常要面对淹水胁迫影响。因此,耐淹水胁迫资源和基因的挖掘是荷花育种目标之一。
随着分子生物学研究的不断发展,功能基因研究已成为植物抗逆育种的重要手段,基因表达分析则是植物功能基因研究的基础。为了校正不同样本RNA提取效率、质量、反转录效率及扩增效率上的差异,通常在基因表达分析中需要用到在细胞中表达恒定的基因即内参基因作为标准。在比较耐淹水品种基因表达差异的研究过程中,较多的涉及到应用qPCR验证和分析基因表达模式和水平,因此筛选淹水胁迫条件下稳定表达的内参基因对qPCR结果有着关键的作用。
发明内容
本发明的目的在于克服现有技术存在的以上问题,提供适用于荷花淹水胁迫基因表达研究的内参基因,本发明解决了荷花淹水胁迫基因表达研究中没有内参基因的现状。
为实现上述技术目的,达到上述技术效果,本发明通过以下技术方案实现:
适用于荷花淹水胁迫基因表达研究的内参基因,内参基因包括:荷花肌动蛋白actin基因和核糖体蛋白18sRNA基因。
优选地,所述荷花肌动蛋白actin基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.1。
优选地,所述核糖体蛋白18sRNA基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.2。
优选地,荷花肌动蛋白actin基因的引物为SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9。
优选地,核糖体蛋白18sRNA基因的引物为SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7。
优选地,荷花肌动蛋白actin基因在荷花耐淹水胁迫基因筛选或研究中的应用。
优选地,核糖体蛋白18sRNA基因在荷花耐淹水胁迫基因筛选或研究中的应用。
本发明的有益效果是:
发明公开了2个用于研究荷花淹水胁迫基因表达的内参基因,并揭露了利用这2个基因为基础设计的实时荧光定量PCR引物,解决了荷花淹水胁迫基因表达研究中没有内参基因的现状,本发明的内参基因可在荷花应对淹水胁迫时稳定表达,所设计的实时荧光定量PCR引物用于荷花应对淹水胁迫时的基因表达分析,可提高研究的稳定性、可靠性和重复性。
上述说明仅是本发明技术方案的概述,为了能够更清楚了解本发明的技术手段,并可依照说明书的内容予以实施,以下以本发明的较佳实施例详细说明如后。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例技术中的技术方案,下面将对实施例技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1是本发明18sRNA5的溶解曲线;
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