[发明专利]用于检测产气肠杆菌的LAMP引物组、试剂盒及快速检测方法有效
申请号: | 201710220611.0 | 申请日: | 2017-04-06 |
公开(公告)号: | CN107012218B | 公开(公告)日: | 2020-09-15 |
发明(设计)人: | 芮勇宇;杨秋;李思 | 申请(专利权)人: | 南方医科大学南方医院 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/689;C12Q1/10;C12N15/11 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 谭英强 |
地址: | 510515 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 产气肠杆菌 lamp 引物 试剂盒 快速 方法 | ||
1.用于检测产气肠杆菌的LAMP引物组,所述LAMP引物组包括一对外引物、一对内引物和一对环引物,其核苷酸序列分别如下所示:
ThdF-F3:5’-GCGATCGTCACCGATATC-3’;
ThdF-B3:5’-GGTAATCGGCAGCTTAGC-3’;
ThdF-FIP:5’-CCACTTCATCACTGGCGTCAATTCACATCGACGGTATGC-3’;
ThdF-BIP:5’-GCGAATCGGCATTGAACGCGCCGTCGACCATAAACAG-3’;
ThdF-LF:5’-GCCTGCGGTATCGATGATAT-3’;
ThdF-LB:5’-ATTGAACAGGCGGATCGG-3’。
2.用于检测产气肠杆菌的试剂盒,包括权利要求1所示的LAMP引物组、DNA聚合酶、反应液、显色剂、荧光染料、封闭液、阳性对照和阴性对照;
其中,所述外引物、内引物、环引物的摩尔比为:(1~2):(4~8):(2~4)。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:反应液为含有20mM pH值为8.8的三羟基甲基氨基甲烷-盐酸、10mM氯化钾、10mM硫酸铵、8mM硫酸镁、0.1%曲拉通X-100、甜菜碱0.8mM、4种dNTPs均2.8mM。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:荧光染料为SYBR GREEN Ⅰ。
5.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:显色剂为钙黄绿素与锰离子配合物,所述钙黄绿素与锰离子配合物的混合体积比为1:10~15。
6.非疾病诊断目的的产气肠杆菌的快速检测方法,包括如下步骤:
(1)提取待检样品DNA;
(2)利用权利要求1的LAMP引物组对待检样品DNA进行恒温荧光扩增或恒温扩增;
所述恒温荧光扩增反应在qPCR仪器中进行,实时读取荧光信号;若有“S”型扩增曲线,则判断为阳性,若无“S”型扩增曲线,则判断为阴性;
所述恒温扩增反应在恒温装置下进行,反应结束后加入1~2μL的显色剂,混匀后即可观察反应液的颜色:若呈现荧光黄绿色,则判断为阳性,若呈现橙色,则判断为阴性;
所述恒温荧光扩增反应的25μL反应体系含有:ThdF-F3 0.02μM、ThdF-B3 0.02μM、ThdF-FIP 0.16μM、ThdF-BIP 0.16μM、ThdF-LF 0.08μM、ThdF-LB 0.08μM、反应液12.5μL、DNA聚合酶2μL、待检样品DNA 2μL、荧光染料0.5μL,用超纯水补齐到25μL;反应体系混匀后,加入20μL密封液;恒温荧光扩增反应的条件为60~65℃反应55~65min。
7.根据权利要求6所述的非疾病诊断目的的产气肠杆菌的快速检测方法,其特征在于:所述恒温扩增反应的25μL反应体系含有:ThdF-F3 0.02μM、ThdF-B3 0.02μM、ThdF-FIP0.16μM、ThdF-BIP 0 .16μM、ThdF-LF 0.08μM、ThdF-LB 0.08μM、反应液12.5μL、DNA聚合酶2μL、待检样品DNA 2μL,用超纯水补齐到25μL;反应体系混匀后,加入20μL密封液;恒温荧光扩增反应的条件为60~65℃反应55~65min。
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