[发明专利]一种快速构建扩增子文库的融合引物组合在审

申请号：	201710219007.6	申请日：	2017-04-05
公开（公告）号：	CN106906210A	公开（公告）日：	2017-06-30
发明（设计）人：	阎海;王思振;焦宇辰;徐大勇;郑乔松;师晓	申请（专利权）人：	北京泛生子医学检验实验室有限公司
主分类号：	C12N15/11	分类号：	C12N15/11;C12N15/10;C12Q1/68;C40B50/06
代理公司：	北京中誉威圣知识产权代理有限公司11279	代理人：	田昕,司丽春
地址：	102206 北京市昌平区回龙观镇中关村***	国省代码：	北京;11
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摘要：
搜索关键词：	一种快速构建扩增文库融合引物组合
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【权利要求书】：

1.一种用于构建DNA样品的扩增子文库的融合引物组合，其特征在于，包括：根据目标扩增子设计的上游融合引物和根据目标扩增子设计的下游融合引物，其中：

所述根据目标扩增子设计的上游融合引物包括按照5’到3’的方向依次排列的第一接头序列(A序列)、barcode序列、第二接头序列和根据目标扩增子设计的特异性上游引物序列；

所述根据目标扩增子设计的下游融合引物包括按照5’到3’的方向依次排列的第三接头序列(trP1序列)和根据目标扩增子设计的特异性下游引物序列。

2.如权利要求1所述的用于构建DNA样品的扩增子文库的融合引物组合，其特征在于：所述第一接头序列包括SEQ ID:1序列；可选的，所述第二接头序列包括核苷酸序列GAT；可选的，所述第三接头序列包括SEQ ID:2序列；可选的，所述barcode序列是与样本相对应的，不同样品之间的barcode序列不同，只要能区分不同样本就可以。

3.如权利要求1所述的用于构建DNA样品的扩增子文库的融合引物组合，其特征在于：当同一个PCR反应中的目标扩增子的数量＞1时，所述根据目标扩增子设计的上游融合引物为根据每一种目标扩增子设计的上游融合引物的组合，所述根据目标扩增子设计的下游融合引物为根据每一种目标扩增子设计的下游融合引物的组合。

4.如权利要求1所述的用于构建DNA样品的扩增子文库的融合引物组合，其特征在于：根据任意一种目标扩增子设计的上游融合引物和根据该目标扩增子设计的下游融合引物的摩尔比为1:1。

5.如权利要求1所述的用于构建DNA样品的扩增子文库的融合引物组合，其特征在于：所述DNA样品为基因组DNA；可选的，基因组DNA提取自组织样本或福尔马林固定石蜡包埋样本。

6.如权利要求1所述的用于构建DNA样品的扩增子文库的融合引物组合，其特征在于：所述目标扩增子包括选自下组22种目标扩增子中的至少一个：

ALK基因的Chr2:29432588-29432707(Hg19)扩增子，其序列如SEQ ID:3所；

ALK基因的Chr2:29443616-29443730(Hg19)扩增子，其序列如SEQ ID:4所示；

BRAF基因的Chr7:140453091-140453197(Hg19)扩增子，其序列如SEQ ID:5所示；

EGFR基因的Chr7:55241604-55241726(Hg19)扩增子，其序列如SEQ ID:6所示；

EGFR基因的Chr7:55242398-55242513(Hg19)扩增子，其序列如SEQ ID:7所示；

EGFR基因的Chr7:55248970-55249096(Hg19)扩增子，其序列如SEQ ID:8所示；

EGFR基因的Chr7:55259505-55259621(Hg19)扩增子，其序列如SEQ ID:9所示；

ERBB2基因的Chr17:37880969-37881082(Hg19)扩增子，其序列如SEQ ID:10所示；