[发明专利]一种与母猪产仔性状相关的SNP标记及其检测方法和应用在审
申请号: | 201710199992.9 | 申请日: | 2017-03-30 |
公开(公告)号: | CN106995843A | 公开(公告)日: | 2017-08-01 |
发明(设计)人: | 李平华;黄瑞华;张倩;李卫东 | 申请(专利权)人: | 江苏康乐农牧有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
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地址: | 212300 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 母猪 产仔 性状 相关 snp 标记 及其 检测 方法 应用 | ||
1.一种与母猪产仔性状相关的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记的位点为国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上g. 95537674
核苷酸位点,且存在G/T多态性,所述SNP标记与母猪窝产活仔数极显著相关。
2.一种基于权利要求1所述的SNP开发分子标记的方法,其特征在于以含有权利要求1所述的SNP标记的核苷酸序列为基础序列,设计引物对,以母猪基因组DNA为模板进行PCR扩增,使权利要求1所述的SNP标记转化为分子标记。
3. 根据权利要求21所述的方法,其特征在于所述的引物对序列为上游引物:SEQ ID NO:2,下游引物:SEQ ID NO:3;所述的分子标记序列如SEQ ID NO:1所示,所述的SNP位点位于第255位,存在G/T多态性。
4.按照权利要求2或3的方法得到的分子标记。
5. 根据权利要求4所述的分子标记,其特征在于分子标记序列如SEQ ID NO:1所示,所述的SNP位点位于第255位,存在G/T多态性。
6. 一种用于检测权利要求1所述的SNP标记的引物对,其特征在于上游引物为:SEQ ID NO:2,下游引物为:SEQ ID NO:3。
7.一种检测权利要求1所述的SNP标记的方法,其特征在于包含PCR扩增母猪基因组中含有权利要求1所述的SNP标记的一段序列,对扩增产物进行测序,判读该位点的G/T多态。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于包括以下步骤:
取一头母猪的耳组织样品并提取总DNA;
用已提取的母猪基因组DNA为模板,使用权利要求5所述的引物进行PCR扩增;
扩增产物测序,分析测序结果,判读在SEQ ID NO:1第255位的G/T多态性。
9.权利要求1所述的SNP标记、权利要求4或5所述的分子标记、权利要求6所述的引物在筛选高产母猪品系中的应用。
10. 一种筛选高产母猪品系的方法,其特征在于包括检测母猪g. 95537674核苷酸位点的基因型,选育g. 95537674核苷酸位点的TT型个体作为种猪。
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