[发明专利]结直肠癌的生物标记物

说明书

技术领域：

本发明属于生物医学技术领域，具体涉及基于检测IFITM1及其调控的HERVs相关基因的表达水平来诊断结直肠癌的方法。

背景技术：

1.近年来，多项研究表明IFITM1在多种恶性肿瘤中高表达，如IFITM1在子宫颈癌、食管癌、卵巢癌、脑癌中均高表达，并且在结直肠癌中表达上调并被认为是结直肠癌分子标志物。越来越多人关注其在恶性肿瘤的发生发展及肿瘤早期侵袭中的作用。在结直肠癌中，其仅在肿瘤组织有IFITM1表达，在肠道肿瘤形成过程中Wnt/β-catenin信号通路的激活能诱导IFITM1的表达；在慢性髓系白血病中，其在高危组表达水平低，低危组表达水平高，表达水平高的患者具有更好的预后，因此，有人认为IFITM1可能是慢性髓系白血病患者预后的分子标志物。

2.人内源性逆转录酶病毒(Human endogenous retroviruses,HERVs)是可转座的遗传因子，可以插入人的基因组中，在人基因组中占到8％的比例。其在胚胎发育过程中被激活，IFITM1能保护胚胎和生殖细胞免受内源性逆转录酶病毒和外源性病毒的感染。ERVs包含有长的末端重复序列(LTRs)，能通过H3K9me3组蛋白修饰来抑制其表达，并且可以通过增加基因组DNA甲基化来抑制HERVs的表达。HERVs过表达会导致基因组不稳定，异常表达的HERVs甚至与癌症的发生相关联。

3.前人研究中提议将IFITM1作为结直肠癌分子标志物，经过试验发现在结直肠癌中IFITM1的表达与HERVs表达呈负相关，本发明中以IFITM1及HERVs的表达作为双重标准来作为结直肠癌的标志物。

发明内容：

本发明的目的在于提供一种IFITM1及其调控的HERVs在结直肠癌标记中的用途。具体说，本发明涉及IFITM1蛋白及其调控的HERVs在结直肠癌诊断试剂盒中的应用。本发明的实施能提供更加准确的结直肠癌的诊断。

本发明的技术方案

一种蛋白及其调控的基因即人内源性逆转录病毒在制备用于检测受试者中存在结直肠癌的体外方法中的试剂盒中的用途，该用途包括：检测该IFITM1及其调控的基因即人内源性逆转录病毒(HERVs)在受试者的测定细胞即结直肠活检测样品中的表达；将所述的测定值与参考值相比较，IFITM1明显高于参考值并且HERVs明显低于参考值，表明受试者可能患有结直肠癌。

所述参考值水平是IFITM1和HERVs相关基因在正常细胞即结直肠活检测样品中的水平。所述正常细胞是相同受试者中与测定细胞相同类型的细胞。所述正常细胞是受试者中与测定细胞相同类型的细胞，所述受试者没有癌症。所述样品已知或被怀疑包含肿瘤细胞。

1.本发明至少部分基于对在人结直肠中高表达的IFITM1及在结直肠癌肿瘤中普遍低表达的HERVs基因的鉴定。本发明的方法对于结直肠癌的检测有用。

2.利用IFITM1和HERVs作为生物标记诊断结直肠癌。

3.本申请所描述的方法可用于诊断受试者中的结直肠癌的存在。在一些具体实施方案中，所述的方法包括，从受试者获取样品，评估所述样品中IFITM1和HERVs存在和/或水平，将所述的存在和/或水平与一个或以上的参照相比较，例如代表正常IFITM1和HERVs水平的对照参照，如来自未受影响的受试者或来自相同个体的正常细胞的中的水平。

4.样品：在本发明的方法的一些具体实施方案中，所述的样品是包括已知的或被怀疑的肿瘤细胞，例如是活检样品。在一些具体实施方案中，所述的样品是冷冻的，固定的和/或经渗透处理的,例如是福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的样品或冰冻在液氮中的样品。