[发明专利]与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用

说明书

本发明提供了与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用，属于家畜分子标记领域，所述基因片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其中第8358bp、15306bp处分别有C8358T、G15306T单碱基突变，且该8358bp的SNP位点与水牛产奶量显著相关，该15306bp的SNP位点与水牛产奶量、乳蛋白率和乳糖率显著相关。本发明公开了检测序列表SEQ ID NO:1的各碱基突变位点所需的上下游引物序列。本发明的应用，可以提高奶水牛产奶性能，为选育具有高产奶量、奶中乳蛋白率高、奶中乳糖率高的优良的奶水牛提供技术支撑和奠定理论基础。

【技术领域】

本发明涉及技术领域，具体涉及一种动物分子标记领域。具体涉及与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用。

【背景技术】

水牛是我国南方特有的种畜资源，而较低的产奶量和繁殖性能已成为了影响其产业发展的两大科学问题。显然，利用先进的分子标记技术应用于优良奶水牛种质资源的选育将会有效的提高选种效率。

产奶性状是奶水牛的一个重要经济性状，由多种微效基因决定，是一种典型的由多基因控制的数量性状。克隆奶水牛泌乳性能相关基因并探讨其遗传特性，以提高奶水牛生产性能，为选育具有高产奶量的优良的奶水牛品种提供技术支撑和奠定理论基础。

众所知周，SREBP是一种膜结合蛋白，属于碱性螺旋-环-螺旋亮氨酸拉链转录因子家族，主要通过糖酵解和脂肪生成而在能量平衡中发挥重要作用(Eberle et al.,2004；Jeon et al.,2012)。先前研究发现，脊椎动物表达两种SREBP基因(SREBP1和SREBP2)，SREBP1基因主要激活脂肪酸的合成(Horton et al.,2002)。在人和小鼠上，SREBP1基因通过第一外显子的一个可变剪接表达2个亚型蛋白，即SREBP1a和SREBP1c，而牛上并未发现(Eberle et al.,2004；Hoashi et al.,2007)。到目前为止，已有许多研究证实SREBP1基因对动物的生产性状具有显著的遗传效应，如肥胖(Liu et al.,2014)、脂肪酸组成(Hoashiet al.,2007)以及胴体(Matsuhashi et al.,2011)。起初，Abe等(2008)和Morris等(2007)在牛SREBP1基因上鉴定出一个QTL区域，位于牛19号染色体的60-80cM处，对脂肪组织中的脂肪酸的组成具有影响作用。随后，Rincon等(2012)报道了牛SREBP1基因rs41912290位点对低脂乳综合征具有影响。此外，Manunza A.等(2012)在奶山羊SREBP1中鉴定出c.353CT位点显著影响乳组成。然而，迄今为止尚无有关水牛SREBP1基因作为水牛产奶性状的分子标记研究报道。

【发明内容】

本发明的发明目的在于：针对上述存在的问题，提供与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用，以提高奶水牛产奶量生产性能，为选育具有高产奶量的优良的奶水牛品种提供技术支撑和奠定理论基础。

为了实现上述目的，本发明采用的技术方案如下：

本发明提供了与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用，所述的分子标记的核苷酸序列如SEQ NO:1所示，其中在SEQ NO:1的第8358bp、15306bp处分别有C8358T、G15306T单碱基突变，其引物对的DNA序列如下所示：

(ⅰ)获得C8358T位点的引物序列为：

正向引物SEQ NO:2：5’-CTGTGAGCGTGGGCTCCTGCGGG-3’；

反向引物SEQ NO:3：5’-GTCATTGATGGAAGAGCGGTAG-3’；

(ⅱ)获得G15306T位点的引物序列为：

正向引物SEQ NO:4：5’-GAGCTCTTACCTGCAGCTTCT-3’；